Essa é uma revisão anterior do documento!
Setup and Linux Install
Here there are how to install from an "fresh" linux installation. Here we assume an Ubuntu (gutsy) installation but and appropriate changes should be done for other Linux "flavors".
We will also assume you have root access to the system, altough many instructions can also use sudo
1. Installaing the [[http://www.r-project.org|R software]]
1.1 Add the R repository in the source.list (alternativelly you may use the synaptic tool).
1.1.1 Open the file:
$ sudo su - root$ vim /etc/apt/sources.list
1.1.2 Add the repository by including the following line to the source.list file
deb http://cran.r-project.org/bin/linux/ubuntu gutsy/
1.2.3 Install the keys (Ubuntu specific)
root$ gpg --keyserver subkeys.pgp.net --recv-key E2A11821 root$ gpg -a --export E2A11821 | sudo apt-key add - root$ apt-get update
1.2.4 Install R
root$ apt-get install r-base r-base-core r-base-html r-base-latex r-doc-html r-doc-info r-doc-pdf r-recommended
2. Install other tools
root$ sudo apt-get install g++ libpq-dev gfortran xemacs21 ess
3. Get the tools to install **aRT** dependencies
This includes installing a MySQL data base and compiling TerraLib
root$ wget http://www.leg.ufpr.br/aRT/install-aRT-dep.zip root$ unzip install-aRT-dep.zip root$ sudo ./install-aRT-dep.sh --add-system-variables
Neste ultimo passo uma série de programas do Ubuntu foram atualizados e/ou instalados. (Clicar em (S) qudo solicitado para instalar o programa). Em particular foi instalado o banco MySQL.
Nota: Na instalação é pedida a senha de "root" para o administrador do banco, que não é a mesma do sistema!
The last step takes a long time compiling Terralib.
Ainda neste último passo, após a atualização dos programas do Ubuntu é automaticamente feita o download e compilação do TerraLib/TerraView (e isto demora MUITO!!!).
A seguir faça crie o link simbólico
$ sudo ln -s /usr/local/terralib/aplicativos/terraView/linux/terraView /usr/bin $ source /etc/bash.bashrc
Installing R packages: aRT and sp
Start R:
root$ R
At the R prompt ( > ) type the following commands to install the packages sp and aRT. aRT depends on sp since uses the representation of spatial objects defined by this package.
> install.packages("sp", dep=T, repos="http://cran.fiocruz.br/")
> install.packages("aRT", contrib="http://www.leg.ufpr.br/aRT")
Installing other R Spatial packages
You may wish to install other Spatial packages from the R-PROJECT. Required packages can be installed individually or the entire CRAN SPATIAL Task View can be installed as follows from the R prompt.
> install.packages("ctv", dep=T, repos="http://cran.fiocruz.br/")
> require(ctv)
> install.views("Spatial") ## takes a loooooog time
Para dar privilégions totais a um usuário no MySQL:
- Inicie o mysql na linha de comando do LINUX com:
$ mysql -u root -p
- No prompt do MySQL: (indicado por >) digite, por exemplo apra o usuário aluno):
> grant all privileges on *.* to aluno@localhost
