Não foi possível enviar o arquivo. Será algum problema com as permissões?
Diferenças
Aqui você vê as diferenças entre duas revisões dessa página.
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software:art:install [2007/12/10 16:28] paulojus |
software:art:install [2007/12/11 09:35] paulojus |
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| Linha 1: | Linha 1: | ||
| ====== Setup and Linux Install ====== | ====== Setup and Linux Install ====== | ||
| - | Here there are how to install from an "fresh" linux instalation | + | Here there are how to install from an "fresh" linux installation. Here we assume an ''Ubuntu (gutsy)'' installation but and appropriate changes should be done for other Linux "flavors". |
| + | 1. Installaing the [[http://www.r-project.org|R software]] | ||
| + | |||
| + | 1.1 Add the R repository in the ''source.list'' (alternativelly you may use the synaptic tool).\\ | ||
| + | |||
| + | 1.1.1 Open the file:\\ | ||
| $ sudo su - | $ sudo su - | ||
| root$ vim /etc/apt/sources.list | root$ vim /etc/apt/sources.list | ||
| - | Adicione no arquivo sources.list a linha do repositório do R:\\ | + | 1.1.2 Add the repository by including the following line to the ''source.list'' file\\ |
| - | + | deb http://cran.r-project.org/bin/linux/ubuntu gutsy/ | |
| - | deb http://cran.r-project.org/bin/linux/ubuntu gutsy/ | + | |
| - | Agora instale as chaves do repositório do R para o Ubuntu | + | 1.2.3 Install the keys (Ubuntu specific)\\ |
| root$ gpg --keyserver subkeys.pgp.net --recv-key E2A11821 | root$ gpg --keyserver subkeys.pgp.net --recv-key E2A11821 | ||
| root$ gpg -a --export E2A11821 | sudo apt-key add - | root$ gpg -a --export E2A11821 | sudo apt-key add - | ||
| root$ apt-get update | root$ apt-get update | ||
| - | Neste pondo pode-se voltar ao usuario com permissoes de sudo | + | 1.2.4 Install R |
| + | root$ apt-get install r-base r-base-core r-base-html r-base-latex r-doc-html r-doc-info r-doc-pdf r-recommended | ||
| + | |||
| + | 2. Install other tools\\ | ||
| + | $ sudo apt-get install g++ libpq-dev gfortran xemacs21 ess | ||
| + | |||
| + | |||
| + | Neste pondo pode-se voltar ao usuário com permissões de sudo | ||
| - | $ sudo apt-get install g++ libpq-dev | ||
| - | $ sudo apt-get install r-base r-base-core r-base-html r-base-latex r-doc-html r-doc-info r-doc-pdf r-recommended | ||
| $ wget http://www.leg.ufpr.br/aRT/install-aRT-dep.zip | $ wget http://www.leg.ufpr.br/aRT/install-aRT-dep.zip | ||
| $ unzip install-aRT-dep.zip | $ unzip install-aRT-dep.zip | ||
| Linha 35: | Linha 44: | ||
| $ source /etc/bash.bashrc | $ source /etc/bash.bashrc | ||
| - | Inicie o R como sudo i instale pacotes necessários | + | Inicie o R como sudo e instale pacotes necessários |
| $ sudo R | $ sudo R | ||
| Linha 44: | Linha 53: | ||
| > install.packages("aRT", contrib="http://www.leg.ufpr.br/aRT") | > install.packages("aRT", contrib="http://www.leg.ufpr.br/aRT") | ||
| - | E faça tb (ainda no R) | + | E para instalar **todos** os pacotes de análise espacial do R faça tb (ainda no prompt do R): |
| > install.packages("ctv", dep=T, repos="http://cran.fiocruz.br/") | > install.packages("ctv", dep=T, repos="http://cran.fiocruz.br/") | ||
| > require(ctv) | > require(ctv) | ||
| > install.views("Spatial") ## bastante demorado!! | > install.views("Spatial") ## bastante demorado!! | ||
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| + | Para dar privilégions totais a um usuário no MySQL: | ||
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| + | - Inicie o mysql na linha de comando do LINUX com: | ||
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| + | $ mysql -u root -p | ||
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| + | - No ''prompt'' do MySQL: (indicado por >) digite, por exemplo apra o usuário aluno): | ||
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| + | > grant all privileges on *.* to aluno@localhost | ||
