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Diferenças
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software:art:install [2007/12/10 16:25] paulojus |
software:art:install [2007/12/11 09:50] paulojus |
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| Linha 1: | Linha 1: | ||
| ====== Setup and Linux Install ====== | ====== Setup and Linux Install ====== | ||
| - | Here there are how to install from an "fresh" linux instalation | + | Here there are how to install from an "fresh" linux installation. Here we assume an ''Ubuntu (gutsy)'' installation but and appropriate changes should be done for other Linux "flavors". |
| + | We will also assume you have ''root'' access to the system, altough many instructions can also use ''sudo'' | ||
| + | |||
| + | === 1. Installaing the [[http://www.r-project.org|R software]] === | ||
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| + | 1.1 Add the R repository in the ''source.list'' (alternativelly you may use the synaptic tool).\\ | ||
| + | |||
| + | 1.1.1 Open the file:\\ | ||
| $ sudo su - | $ sudo su - | ||
| root$ vim /etc/apt/sources.list | root$ vim /etc/apt/sources.list | ||
| - | Adicione no arquivo sources.list a linha do repositório do R: | + | 1.1.2 Add the repository by including the following line to the ''source.list'' file\\ |
| - | + | deb http://cran.r-project.org/bin/linux/ubuntu gutsy/ | |
| - | ''deb http://cran.r-project.org/bin/linux/ubuntu gutsy/'' | + | |
| - | Agora instale as chaves do repositório do R para o Ubuntu | + | 1.2.3 Install the keys (Ubuntu specific)\\ |
| root$ gpg --keyserver subkeys.pgp.net --recv-key E2A11821 | root$ gpg --keyserver subkeys.pgp.net --recv-key E2A11821 | ||
| root$ gpg -a --export E2A11821 | sudo apt-key add - | root$ gpg -a --export E2A11821 | sudo apt-key add - | ||
| root$ apt-get update | root$ apt-get update | ||
| - | Neste pondo pode-se voltar ao usuario com permissoes de sudo | + | 1.2.4 Install R |
| + | root$ apt-get install r-base r-base-core r-base-html r-base-latex r-doc-html r-doc-info r-doc-pdf r-recommended | ||
| - | $ sudo apt-get install g++ libpq-dev | + | === 2. Install other tools === |
| - | $ sudo apt-get install r-base r-base-core r-base-html r-base-latex r-doc-html r-doc-info r-doc-pdf r-recommended | + | root$ sudo apt-get install g++ libpq-dev gfortran xemacs21 ess |
| - | $ wget http://www.leg.ufpr.br/aRT/install-aRT-dep.zip | + | |
| - | $ unzip install-aRT-dep.zip | + | |
| - | $ sudo ./install-aRT-dep.sh --add-system-variables | + | |
| - | Este ultimo passo deve demorar bastante! | + | === 3. Get the tools to install **aRT** dependencies === |
| + | This includes installing a ''MySQL'' data base and compiling ''TerraLib''\\ | ||
| + | root$ wget http://www.leg.ufpr.br/aRT/install-aRT-dep.zip | ||
| + | root$ unzip install-aRT-dep.zip | ||
| + | root$ sudo ./install-aRT-dep.sh --add-system-variables | ||
| - | Neste ultimo passo uma série de programas do Ubuntu foram atualizados e/ou instalados. (Clicar em (S) qudo solicitadopara instalar o programa). Em particular foi instalado o banco MySQL. Na instalação foi pedida a senha de "root" para o administrador do banco. MySQL que defini como sendo 'aluno' | + | Neste ultimo passo uma série de programas do Ubuntu foram atualizados e/ou instalados. (Clicar em (S) qudo solicitado para instalar o programa). Em particular foi instalado o banco MySQL. \\ |
| + | **Nota:** Na instalação é pedida a senha de "root" para o administrador do banco, que não é a mesma do sistema! | ||
| - | Ainda neste último passo, após a atualização dos programas do Ubuntu é automaticamente feita o download e compilação do TerraLib/TerraView (e isto demora MUITO!!!) | + | The last step takes a long time compiling ''Terralib''. |
| - | + | Ainda neste último passo, após a atualização dos programas do Ubuntu é automaticamente feita o download e compilação do TerraLib/TerraView (e isto demora MUITO!!!). | |
| - | A seguir faça crie o link simbólico | + | |
| + | A seguir faça crie o link simbólico\\ | ||
| $ sudo ln -s /usr/local/terralib/aplicativos/terraView/linux/terraView /usr/bin | $ sudo ln -s /usr/local/terralib/aplicativos/terraView/linux/terraView /usr/bin | ||
| $ source /etc/bash.bashrc | $ source /etc/bash.bashrc | ||
| - | Inicie o R como sudo i instale pacotes necessários | + | === Installing R packages: aRT and sp === |
| - | + | Start R:\\ | |
| - | $ sudo R | + | root$ R |
| - | + | ||
| - | Na linha de comando do R ( > ) digite: | + | |
| + | At the R prompt ''( > )'' type the following commands to install the packages ''sp'' and ''aRT''. ''aRT'' depends on ''sp'' since uses the representation of spatial objects defined by this package. \\ | ||
| > install.packages("sp", dep=T, repos="http://cran.fiocruz.br/") | > install.packages("sp", dep=T, repos="http://cran.fiocruz.br/") | ||
| > install.packages("aRT", contrib="http://www.leg.ufpr.br/aRT") | > install.packages("aRT", contrib="http://www.leg.ufpr.br/aRT") | ||
| - | E faça tb (ainda no R) | + | === Installing other R Spatial packages === |
| + | You may wish to install other **Spatial** packages from the R-PROJECT. Required packages can be installed individually or the entire //CRAN SPATIAL Task View// can be installed as follows from the R prompt.\\ | ||
| > install.packages("ctv", dep=T, repos="http://cran.fiocruz.br/") | > install.packages("ctv", dep=T, repos="http://cran.fiocruz.br/") | ||
| > require(ctv) | > require(ctv) | ||
| - | > install.views("Spatial") ## bastante demorado!! | + | > install.views("Spatial") ## takes a loooooog time |
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| + | Para dar privilégions totais a um usuário no MySQL: | ||
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| + | - Inicie o mysql na linha de comando do LINUX com: | ||
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| + | $ mysql -u root -p | ||
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| + | - No ''prompt'' do MySQL: (indicado por >) digite, por exemplo apra o usuário aluno): | ||
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| + | > grant all privileges on *.* to aluno@localhost | ||
