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disciplinas:geoesalq:historico [2014/08/15 17:59]
paulojus
disciplinas:geoesalq:historico [2016/12/09 09:18] (atual)
paulojus
Linha 17: Linha 17:
       - Obter outro conjunto de dados geoestatísticos (seu próprio ou em alguma fonte - web etc), carregar no R e efetuar análises       - Obter outro conjunto de dados geoestatísticos (seu próprio ou em alguma fonte - web etc), carregar no R e efetuar análises
       - Reproduzir e discutir as análises feitas com os comandos a seguir:       - Reproduzir e discutir as análises feitas com os comandos a seguir:
-        - {{:​disciplinas:​geoesalq:​pira2014:​wolfcamp.txt|arquivo de dados}} e {{:​disciplinas:​geoesalq:​pira2014:​wolf.r|{{:​disciplinas:​geoesalq:​pira2014:​wolf.r|de comandos}}}} +        - {{:​disciplinas:​geoesalq:​pira2014:​wolfcamp.txt|arquivo de dados}} e {{:​disciplinas:​geoesalq:​pira2014:​wolf.r|de comandos}} ​
  
-  * 14/08+  * 15/08
     * Manhã: atividades computacionas     * Manhã: atividades computacionas
     * Tarde: modelos com covariaveis - tendências com coordenadas e com covariáveis     * Tarde: modelos com covariaveis - tendências com coordenadas e com covariáveis
Linha 27: Linha 27:
         - {{:​disciplinas:​geoesalq:​pira2014:​wolf.r|wolfcamp revisado}}         - {{:​disciplinas:​geoesalq:​pira2014:​wolf.r|wolfcamp revisado}}
  
 +
 +=== Semana 2 ===
 +  * 21/08
 +   * Discussão sobre variogramas
 +   * Extensões dos modelos considerando covariáveis e transformações
 +   * Apresentação e discussão de trabalhos, dados e projetos de participantes
 +  * 22/08
 +    * Manhã
 +      * {{:​disciplinas:​geoesalq:​modelos-pr.r|alguns modelos para dados de precipitação no PR}}
 +      * {{:​disciplinas:​geoesalq:​modelo-ca20.r|alguns modelos para dados Ca20}}
 +      * Exemplo de código básico para predição espacial ({{:​disciplinas:​geoesalq:​ex-predicao.r|arquivo de comandos}}),​ incluindo exportação dos resultados
 +      * {{:​disciplinas:​geoesalq:​pira2014:​krigacamg.r|Um exemplo mais completo de comandos para análise}} ​
 +        * {{:​disciplinas:​geoesalq:​pira2014:​regioes.dat|arquivo de dados}} utilizados no arquivo de comandos
 +    * Tarde
 +      * além de krigagem: Simulações da preditiva (condicionais)
 +      * {{:​disciplinas:​geoesalq:​pira2014:​comandos-intro-2014.r|arquivo de comandos atualizado}}
 +
 +=== Semana 3 ===
 +  * 18/09
 +    * Manhã: ​
 +      - simulação e funções de correlação
 +      - estimação por verossimilhança
 +    * Tarde
 +      - Predição espacial e efeitos do modelo na predição
 +      - inferência e predição Bayesiana ​  
 +  * 19/09
 +    * Manhã:
 +      - {{:​disciplinas:​geoesalq:​pira2014:​aula-2014-09-18.r|arquivo com comandos da aula do dia anterior}} - revisão, alterar e expandir os comandos
 +      - Mais simulações:​ {{:​disciplinas:​geoesalq:​comandos-simula.r|arquivo 2}} simulações do modelo geoestatístico básico no R, feitas de várias formas
 +      - {{:​disciplinas:​geoesalq:​pira2012:​comandosintro.r|arquivo de comandos}} de uma análise incluindo inferência Bayesiana
 +    * Tarde:
 +      - Modelos não gaussianos.
 +        - {{:​disciplinas:​geoesalq:​simular-glgm.r|arquivo 5}} Simulação de modelos GLM geoestatísticos (Poisson e Binomial)
 +        -  Análises usando a geoRglm:
 +          * {{:​disciplinas:​geoesalq:​poisson-sim.r|Análise com o modelo Poisson geoestatístico}} ​
 +          * {{:​disciplinas:​geoesalq:​binario-1d.r|arquivo com código}} para exemplo de simulação e análise de dados binários em 1-D
 +          * {{:​disciplinas:​geoesalq:​simbin.txt|arquivo de dados binários}} para análise com geoRglm
 +      - Representação de dados espaciais no R pelo pacote sp. SpatialPolygons e algumas visualizações e análises de dados de áreas
 +        - {{:​disciplinas:​geoesalq:​pira2014:​aucklandnew.r|Arquivo de comandos visto na aula}}
 +        - Convertendo um objeto de áreas/​polígonos em geodata (centroides como coordenadas) ​
 +          * {{:​disciplinas:​geoesalq:​area2geo.r|arquivo de comandos}}
 +          * Arquivos shapefile {{:​disciplinas:​cieg:​bairros.shp|}} {{:​disciplinas:​cieg:​bairros.shx|}} {{:​disciplinas:​cieg:​bairros.dbf|}}
 +          * {{:​disciplinas:​cieg:​tabe.csv|Atributos dos bairros}}
 +        - Montar geodata a partir da importação de dados de centroides de municípios do Paraná
 +          * shape com o estado do PR ({{:​disciplinas:​geoesalq:​41uf2500g.dbf|arquivo dbf}}, {{:​disciplinas:​geoesalq:​41uf2500g.shp|arquivo shp}}, {{:​disciplinas:​geoesalq:​41uf2500g.shx|arquivo shx}})
 +          * shape com os municípios do PR ({{:​disciplinas:​geoesalq:​41mu2500g.dbf|arquivo dbf}}, {{:​disciplinas:​geoesalq:​41mu2500g.shp|arquivo shp}}, {{:​disciplinas:​geoesalq:​41mu2500g.shx|arquivo shx}})
 +          * {{:​disciplinas:​geoesalq:​prodsoja.txt|arquivo de atributos}}
 +          * {{:​disciplinas:​geoesalq:​rotina.r|Script de análise}}
 +
 +=== Semana 4 ===
 +  * 09/10: Estudos de caso, extensões e outras análises (processos pontuais e áreas) ​
 +    * Manhã: ​
 +      * SKATER
 +      * Análise espacial de experimentos
 +      * Dados composicionais (frações de solo)
 +      * {http://​www.ij-healthgeographics.com/​content/​10/​1/​17|Padrão espacial na resistência a antibióticos - EUREQA}
 +    * Tarde:
 +      * Abundância por classes de idade (pescada)
 +      * Zona de captura
 +      * Relação de variáveis de solo e ocorrência de espécies (Djair)
 +      * Processos pontuais (princípios e conceitos básicos)
 +  * 10/10
 +    * Tarde:
 +      * Apresentação e discussão de análises, temas e projetos de participantes do curso
 +      * Modelo/​código para Análise conjunta de diversas áreas
  
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Linha 60: Linha 125:
       * Arquivos de comandos com exemplos de análises (examinar antes da próxima aula)       * Arquivos de comandos com exemplos de análises (examinar antes da próxima aula)
         - {{:​disciplinas:​geoesalq:​dadosmalha.txt|arquivo de dados usado no script}}         - {{:​disciplinas:​geoesalq:​dadosmalha.txt|arquivo de dados usado no script}}
-          * {{:​disciplinas:​geoesalq:​porot.r|Comandos vistos em aula}} para pororidade ​total+          * {{:​disciplinas:​geoesalq:​porot.r|Comandos vistos em aula}} para porosidade ​total
           * {{:​disciplinas:​geoesalq:​aula1-2009.r|Outro arquivo de comandos}} para estes dados           * {{:​disciplinas:​geoesalq:​aula1-2009.r|Outro arquivo de comandos}} para estes dados
         - {{:​disciplinas:​geoesalq:​profund020a.txt|arquivo de dados de teores de elementos}} em camada 0-20{{:​disciplinas:​geoesalq:​pira2012:​acacio-artigo1.pdf|}}         - {{:​disciplinas:​geoesalq:​profund020a.txt|arquivo de dados de teores de elementos}} em camada 0-20{{:​disciplinas:​geoesalq:​pira2012:​acacio-artigo1.pdf|}}
         - {{:​disciplinas:​geoesalq:​sal.dat|dados de salinidade de água}}         - {{:​disciplinas:​geoesalq:​sal.dat|dados de salinidade de água}}
-        - {{:​disciplinas:​geoesalq:​quimicos_c1.txt|arquivo com teores de elementos ​quimicos}} em amostras de solo+        - {{:​disciplinas:​geoesalq:​quimicos_c1.txt|arquivo com teores de elementos ​químicos}} em amostras de solo
       * Sugestão de leitura {{:​disciplinas:​geoesalq:​cap3.pdf|Cap 3 de Diggle & Ribeiro}}       * Sugestão de leitura {{:​disciplinas:​geoesalq:​cap3.pdf|Cap 3 de Diggle & Ribeiro}}
  
Linha 109: Linha 174:
  
   * 05/10   * 05/10
-    * Manhã: ​Representaçao ​e dados espaciais+    * Manhã: ​Representação ​e dados espaciais
       - Convertendo um objeto de áreas/​polígonos em geodata (centroides como coordenadas) ​       - Convertendo um objeto de áreas/​polígonos em geodata (centroides como coordenadas) ​
         * {{:​disciplinas:​geoesalq:​area2geo.r|arquivo de comandos}}         * {{:​disciplinas:​geoesalq:​area2geo.r|arquivo de comandos}}
Linha 243: Linha 308:
       - algumas aplicações de geoestatística:​ análise espacial de experimentos e ánalises conjuntas  ​       - algumas aplicações de geoestatística:​ análise espacial de experimentos e ánalises conjuntas  ​
     * tarde:     * tarde:
-      -  interpolações não eapaciais ​({{:​disciplinas:​geoesalq:​interpgeo.r|arquivo de comandos com exemplos e alternativas}}) ​+      -  interpolações não espaciais ​({{:​disciplinas:​geoesalq:​interpgeo.r|arquivo de comandos com exemplos e alternativas}}) ​
       - apresentação alunos (ver material)       - apresentação alunos (ver material)
  

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