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Diferenças
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disciplinas:geoesalq:historico [2014/08/15 00:45] paulojus |
disciplinas:geoesalq:historico [2016/12/09 09:18] (atual) paulojus |
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| Linha 2: | Linha 2: | ||
| ==== Ano 2014 ==== | ==== Ano 2014 ==== | ||
| + | |||
| + | === Semana 1 === | ||
| * 14/08 | * 14/08 | ||
| * Manhã: apresentação, informações sobre o curso, percepções sobre geoestatística. Introdução ao programa R e ao pacote ''geoR''. Leitura de dados, formato geodata e análises exploratórias. | * Manhã: apresentação, informações sobre o curso, percepções sobre geoestatística. Introdução ao programa R e ao pacote ''geoR''. Leitura de dados, formato geodata e análises exploratórias. | ||
| Linha 12: | Linha 14: | ||
| - Verificar outros conjuntos de dados disponíveis no pacote ''geoR'' com o comando <code R> | - Verificar outros conjuntos de dados disponíveis no pacote ''geoR'' com o comando <code R> | ||
| data(package="geoR") | data(package="geoR") | ||
| - | </code> | + | </code> e efetuar análises descritivas atentando as características a serem observadas comentadas em aula (distribuição e assimetria, dados atípicos, tendências com coordenadas e covariáveis, possível padrão espacial) |
| - | e efetuar análises descritivas atentando as características a serem observadas comentadas em aula (distribuição e assimetria, dados atípicos, tendências com coordenadas e covariáveis, possível padrão espacial) | + | |
| - Obter outro conjunto de dados geoestatísticos (seu próprio ou em alguma fonte - web etc), carregar no R e efetuar análises | - Obter outro conjunto de dados geoestatísticos (seu próprio ou em alguma fonte - web etc), carregar no R e efetuar análises | ||
| - Reproduzir e discutir as análises feitas com os comandos a seguir: | - Reproduzir e discutir as análises feitas com os comandos a seguir: | ||
| - | - {{:disciplinas:geoesalq:pira2014:wolfcamp.txt|arquivo de dados}} e {{:disciplinas:geoesalq:pira2014:wolf.r|{{:disciplinas:geoesalq:pira2014:wolf.r|de comandos}}}} | + | - {{:disciplinas:geoesalq:pira2014:wolfcamp.txt|arquivo de dados}} e {{:disciplinas:geoesalq:pira2014:wolf.r|de comandos}} |
| + | |||
| + | * 15/08 | ||
| + | * Manhã: atividades computacionas | ||
| + | * Tarde: modelos com covariaveis - tendências com coordenadas e com covariáveis | ||
| + | * arquivos utilizados: | ||
| + | - {{:disciplinas:geoesalq:pira2014:ca20-2014.r|ca20}} | ||
| + | - {{:disciplinas:geoesalq:pira2014:bordas.r|definição de bordas}} | ||
| + | - {{:disciplinas:geoesalq:pira2014:wolf.r|wolfcamp revisado}} | ||
| + | |||
| + | |||
| + | === Semana 2 === | ||
| + | * 21/08 | ||
| + | * Discussão sobre variogramas | ||
| + | * Extensões dos modelos considerando covariáveis e transformações | ||
| + | * Apresentação e discussão de trabalhos, dados e projetos de participantes | ||
| + | * 22/08 | ||
| + | * Manhã | ||
| + | * {{:disciplinas:geoesalq:modelos-pr.r|alguns modelos para dados de precipitação no PR}} | ||
| + | * {{:disciplinas:geoesalq:modelo-ca20.r|alguns modelos para dados Ca20}} | ||
| + | * Exemplo de código básico para predição espacial ({{:disciplinas:geoesalq:ex-predicao.r|arquivo de comandos}}), incluindo exportação dos resultados | ||
| + | * {{:disciplinas:geoesalq:pira2014:krigacamg.r|Um exemplo mais completo de comandos para análise}} | ||
| + | * {{:disciplinas:geoesalq:pira2014:regioes.dat|arquivo de dados}} utilizados no arquivo de comandos | ||
| + | * Tarde | ||
| + | * além de krigagem: Simulações da preditiva (condicionais) | ||
| + | * {{:disciplinas:geoesalq:pira2014:comandos-intro-2014.r|arquivo de comandos atualizado}} | ||
| + | |||
| + | === Semana 3 === | ||
| + | * 18/09 | ||
| + | * Manhã: | ||
| + | - simulação e funções de correlação | ||
| + | - estimação por verossimilhança | ||
| + | * Tarde | ||
| + | - Predição espacial e efeitos do modelo na predição | ||
| + | - inferência e predição Bayesiana | ||
| + | * 19/09 | ||
| + | * Manhã: | ||
| + | - {{:disciplinas:geoesalq:pira2014:aula-2014-09-18.r|arquivo com comandos da aula do dia anterior}} - revisão, alterar e expandir os comandos | ||
| + | - Mais simulações: {{:disciplinas:geoesalq:comandos-simula.r|arquivo 2}} simulações do modelo geoestatístico básico no R, feitas de várias formas | ||
| + | - {{:disciplinas:geoesalq:pira2012:comandosintro.r|arquivo de comandos}} de uma análise incluindo inferência Bayesiana | ||
| + | * Tarde: | ||
| + | - Modelos não gaussianos. | ||
| + | - {{:disciplinas:geoesalq:simular-glgm.r|arquivo 5}} Simulação de modelos GLM geoestatísticos (Poisson e Binomial) | ||
| + | - Análises usando a geoRglm: | ||
| + | * {{:disciplinas:geoesalq:poisson-sim.r|Análise com o modelo Poisson geoestatístico}} | ||
| + | * {{:disciplinas:geoesalq:binario-1d.r|arquivo com código}} para exemplo de simulação e análise de dados binários em 1-D | ||
| + | * {{:disciplinas:geoesalq:simbin.txt|arquivo de dados binários}} para análise com geoRglm | ||
| + | - Representação de dados espaciais no R pelo pacote sp. SpatialPolygons e algumas visualizações e análises de dados de áreas | ||
| + | - {{:disciplinas:geoesalq:pira2014:aucklandnew.r|Arquivo de comandos visto na aula}} | ||
| + | - Convertendo um objeto de áreas/polígonos em geodata (centroides como coordenadas) | ||
| + | * {{:disciplinas:geoesalq:area2geo.r|arquivo de comandos}} | ||
| + | * Arquivos shapefile {{:disciplinas:cieg:bairros.shp|}} {{:disciplinas:cieg:bairros.shx|}} {{:disciplinas:cieg:bairros.dbf|}} | ||
| + | * {{:disciplinas:cieg:tabe.csv|Atributos dos bairros}} | ||
| + | - Montar geodata a partir da importação de dados de centroides de municípios do Paraná | ||
| + | * shape com o estado do PR ({{:disciplinas:geoesalq:41uf2500g.dbf|arquivo dbf}}, {{:disciplinas:geoesalq:41uf2500g.shp|arquivo shp}}, {{:disciplinas:geoesalq:41uf2500g.shx|arquivo shx}}) | ||
| + | * shape com os municípios do PR ({{:disciplinas:geoesalq:41mu2500g.dbf|arquivo dbf}}, {{:disciplinas:geoesalq:41mu2500g.shp|arquivo shp}}, {{:disciplinas:geoesalq:41mu2500g.shx|arquivo shx}}) | ||
| + | * {{:disciplinas:geoesalq:prodsoja.txt|arquivo de atributos}} | ||
| + | * {{:disciplinas:geoesalq:rotina.r|Script de análise}} | ||
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| + | === Semana 4 === | ||
| + | * 09/10: Estudos de caso, extensões e outras análises (processos pontuais e áreas) | ||
| + | * Manhã: | ||
| + | * SKATER | ||
| + | * Análise espacial de experimentos | ||
| + | * Dados composicionais (frações de solo) | ||
| + | * {http://www.ij-healthgeographics.com/content/10/1/17|Padrão espacial na resistência a antibióticos - EUREQA} | ||
| + | * Tarde: | ||
| + | * Abundância por classes de idade (pescada) | ||
| + | * Zona de captura | ||
| + | * Relação de variáveis de solo e ocorrência de espécies (Djair) | ||
| + | * Processos pontuais (princípios e conceitos básicos) | ||
| + | * 10/10 | ||
| + | * Tarde: | ||
| + | * Apresentação e discussão de análises, temas e projetos de participantes do curso | ||
| + | * Modelo/código para Análise conjunta de diversas áreas | ||
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| ==== Ano 2012 ==== | ==== Ano 2012 ==== | ||
| Linha 46: | Linha 125: | ||
| * Arquivos de comandos com exemplos de análises (examinar antes da próxima aula) | * Arquivos de comandos com exemplos de análises (examinar antes da próxima aula) | ||
| - {{:disciplinas:geoesalq:dadosmalha.txt|arquivo de dados usado no script}} | - {{:disciplinas:geoesalq:dadosmalha.txt|arquivo de dados usado no script}} | ||
| - | * {{:disciplinas:geoesalq:porot.r|Comandos vistos em aula}} para pororidade total | + | * {{:disciplinas:geoesalq:porot.r|Comandos vistos em aula}} para porosidade total |
| * {{:disciplinas:geoesalq:aula1-2009.r|Outro arquivo de comandos}} para estes dados | * {{:disciplinas:geoesalq:aula1-2009.r|Outro arquivo de comandos}} para estes dados | ||
| - {{:disciplinas:geoesalq:profund020a.txt|arquivo de dados de teores de elementos}} em camada 0-20{{:disciplinas:geoesalq:pira2012:acacio-artigo1.pdf|}} | - {{:disciplinas:geoesalq:profund020a.txt|arquivo de dados de teores de elementos}} em camada 0-20{{:disciplinas:geoesalq:pira2012:acacio-artigo1.pdf|}} | ||
| - {{:disciplinas:geoesalq:sal.dat|dados de salinidade de água}} | - {{:disciplinas:geoesalq:sal.dat|dados de salinidade de água}} | ||
| - | - {{:disciplinas:geoesalq:quimicos_c1.txt|arquivo com teores de elementos quimicos}} em amostras de solo | + | - {{:disciplinas:geoesalq:quimicos_c1.txt|arquivo com teores de elementos químicos}} em amostras de solo |
| * Sugestão de leitura {{:disciplinas:geoesalq:cap3.pdf|Cap 3 de Diggle & Ribeiro}} | * Sugestão de leitura {{:disciplinas:geoesalq:cap3.pdf|Cap 3 de Diggle & Ribeiro}} | ||
| Linha 95: | Linha 174: | ||
| * 05/10 | * 05/10 | ||
| - | * Manhã: Representaçao e dados espaciais | + | * Manhã: Representação e dados espaciais |
| - Convertendo um objeto de áreas/polígonos em geodata (centroides como coordenadas) | - Convertendo um objeto de áreas/polígonos em geodata (centroides como coordenadas) | ||
| * {{:disciplinas:geoesalq:area2geo.r|arquivo de comandos}} | * {{:disciplinas:geoesalq:area2geo.r|arquivo de comandos}} | ||
| Linha 229: | Linha 308: | ||
| - algumas aplicações de geoestatística: análise espacial de experimentos e ánalises conjuntas | - algumas aplicações de geoestatística: análise espacial de experimentos e ánalises conjuntas | ||
| * tarde: | * tarde: | ||
| - | - interpolações não eapaciais ({{:disciplinas:geoesalq:interpgeo.r|arquivo de comandos com exemplos e alternativas}}) | + | - interpolações não espaciais ({{:disciplinas:geoesalq:interpgeo.r|arquivo de comandos com exemplos e alternativas}}) |
| - apresentação alunos (ver material) | - apresentação alunos (ver material) | ||
| Linha 614: | Linha 693: | ||
| * {{disciplinas:ce714:r:aula3pira.r|Arquivo com comandos do R}} com análise geoestatística utilizados durante aula | * {{disciplinas:ce714:r:aula3pira.r|Arquivo com comandos do R}} com análise geoestatística utilizados durante aula | ||
| * outro {{disciplinas:ce714:r:aula4pira.r|arquivo com comandos do R}} com análise geoestatística utilizados durante aula | * outro {{disciplinas:ce714:r:aula4pira.r|arquivo com comandos do R}} com análise geoestatística utilizados durante aula | ||
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