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Diferenças
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disciplinas:geoesalq:historico [2012/09/20 14:04] paulojus |
disciplinas:geoesalq:historico [2014/09/18 07:42] paulojus |
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| Linha 1: | Linha 1: | ||
| ====== Histórico das aulas do curso ====== | ====== Histórico das aulas do curso ====== | ||
| + | |||
| + | ==== Ano 2014 ==== | ||
| + | |||
| + | === Semana 1 === | ||
| + | * 14/08 | ||
| + | * Manhã: apresentação, informações sobre o curso, percepções sobre geoestatística. Introdução ao programa R e ao pacote ''geoR''. Leitura de dados, formato geodata e análises exploratórias. | ||
| + | * Tarde: dependência especial: correlogramas e variogramas. Interpolação espacial (krigagem) e mapas de predição. Outros formados de dados espaciais (dados de área e de processos pontuais). | ||
| + | * Atividades: | ||
| + | - Instalar o programa R e o pacote geoR | ||
| + | - Refazer o exemplo trabalhado em sala de aula | ||
| + | - {{:disciplinas:geoesalq:pira2014:dados-intro.txt|Arquivo de dados}} (formato texto) | ||
| + | - {{:disciplinas:geoesalq:pira2014:comandos-intro-2014.r|Arquivo de comandos}} | ||
| + | - Verificar outros conjuntos de dados disponíveis no pacote ''geoR'' com o comando <code R> | ||
| + | data(package="geoR") | ||
| + | </code> e efetuar análises descritivas atentando as características a serem observadas comentadas em aula (distribuição e assimetria, dados atípicos, tendências com coordenadas e covariáveis, possível padrão espacial) | ||
| + | - Obter outro conjunto de dados geoestatísticos (seu próprio ou em alguma fonte - web etc), carregar no R e efetuar análises | ||
| + | - Reproduzir e discutir as análises feitas com os comandos a seguir: | ||
| + | - {{:disciplinas:geoesalq:pira2014:wolfcamp.txt|arquivo de dados}} e {{:disciplinas:geoesalq:pira2014:wolf.r|{{:disciplinas:geoesalq:pira2014:wolf.r|de comandos}}}} | ||
| + | |||
| + | * 15/08 | ||
| + | * Manhã: atividades computacionas | ||
| + | * Tarde: modelos com covariaveis - tendências com coordenadas e com covariáveis | ||
| + | * arquivos utilizados: | ||
| + | - {{:disciplinas:geoesalq:pira2014:ca20-2014.r|ca20}} | ||
| + | - {{:disciplinas:geoesalq:pira2014:bordas.r|definição de bordas}} | ||
| + | - {{:disciplinas:geoesalq:pira2014:wolf.r|wolfcamp revisado}} | ||
| + | |||
| + | |||
| + | === Semana 2 === | ||
| + | * 21/08 | ||
| + | * Discussão sobre variogramas | ||
| + | * Extensões dos modelos considerando covariáveis e transformações | ||
| + | * Apresentação e discussão de trabalhos, dados e projetos de participantes | ||
| + | * 22/08 | ||
| + | * Manhã | ||
| + | * {{:disciplinas:geoesalq:modelos-pr.r|alguns modelos para dados de precipitação no PR}} | ||
| + | * {{:disciplinas:geoesalq:modelo-ca20.r|alguns modelos para dados Ca20}} | ||
| + | * Exemplo de código básico para predição espacial ({{:disciplinas:geoesalq:ex-predicao.r|arquivo de comandos}}), incluindo exportação dos resultados | ||
| + | * {{:disciplinas:geoesalq:pira2014:krigacamg.r|Um exemplo mais completo de comandos para análise}} | ||
| + | * {{:disciplinas:geoesalq:pira2014:regioes.dat|arquivo de dados}} utilizados no arquivo de comandos | ||
| + | * Tarde | ||
| + | * além de krigagem: Simulações da preditiva (condicionais) | ||
| + | * {{:disciplinas:geoesalq:pira2014:comandos-intro-2014.r|arquivo de comandos atualizado}} | ||
| + | |||
| + | === Semana 3 === | ||
| + | * 18/09 | ||
| + | * 19/09 | ||
| + | |||
| + | ---- | ||
| + | ---- | ||
| + | |||
| ==== Ano 2012 ==== | ==== Ano 2012 ==== | ||
| Linha 31: | Linha 82: | ||
| * {{:disciplinas:geoesalq:porot.r|Comandos vistos em aula}} para pororidade total | * {{:disciplinas:geoesalq:porot.r|Comandos vistos em aula}} para pororidade total | ||
| * {{:disciplinas:geoesalq:aula1-2009.r|Outro arquivo de comandos}} para estes dados | * {{:disciplinas:geoesalq:aula1-2009.r|Outro arquivo de comandos}} para estes dados | ||
| - | - {{:disciplinas:geoesalq:profund020a.txt|arquivo de dados de teores de elementos}} em camada 0-20 | + | - {{:disciplinas:geoesalq:profund020a.txt|arquivo de dados de teores de elementos}} em camada 0-20{{:disciplinas:geoesalq:pira2012:acacio-artigo1.pdf|}} |
| - {{:disciplinas:geoesalq:sal.dat|dados de salinidade de água}} | - {{:disciplinas:geoesalq:sal.dat|dados de salinidade de água}} | ||
| - {{:disciplinas:geoesalq:quimicos_c1.txt|arquivo com teores de elementos quimicos}} em amostras de solo | - {{:disciplinas:geoesalq:quimicos_c1.txt|arquivo com teores de elementos quimicos}} em amostras de solo | ||
| * Sugestão de leitura {{:disciplinas:geoesalq:cap3.pdf|Cap 3 de Diggle & Ribeiro}} | * Sugestão de leitura {{:disciplinas:geoesalq:cap3.pdf|Cap 3 de Diggle & Ribeiro}} | ||
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| ==== Semana 2 ==== | ==== Semana 2 ==== | ||
| * 20/09 | * 20/09 | ||
| - | * Manhã: | + | * Manhã: Caracterização dos modelos geoestatísticos e funções de correlação |
| + | * Tarde: | ||
| + | * Relações entre funções de correlação e trajetória dos processos, | ||
| + | * Variograma e função e correlação | ||
| + | * Simulação de processos | ||
| + | * {{:disciplinas:geoesalq:ex-simula.r|Arquivo editado durante a aula}} | ||
| + | * Arquivos utilizados em anos anteriores (revisar/rodar) | ||
| + | * {{:disciplinas:geoesalq:intro-simula.r|Um arquivo de comandos}} com exemplos introdutórios de simulação no R (modelos **não** espaciais) | ||
| + | * {{:disciplinas:geoesalq:simular.r|arquivo 3}} | ||
| + | * {{:disciplinas:geoesalq:comandos-simula.r|arquivo 2}} simulações do modelo geoestatístico básico no R, feitas de várias formas | ||
| + | * {{:disciplinas:geoesalq:grftutorial.r|arquivo de comandos 1}} Um breve tutorial de uso da função ''grf()'' | ||
| + | * {{:disciplinas:geoesalq:simular-glgm.r|arquivo 5}} Simulação de modelos GLM geoestatísticos (Poisson e Binomial) | ||
| + | * Definir e montar um conjunto de simulações. Montar o seu arquivo de comandos. | ||
| + | |||
| + | * **Arquivos editados nas aulas** | ||
| + | * {{:disciplinas:geoesalq:modelos-pr.r|Modelos para dados de precipitação no PR}} | ||
| + | * {{:disciplinas:geoesalq:modelo-ca20.r|Modelos para dados Ca20}} | ||
| + | |||
| + | * **Tarefas** | ||
| + | * Refazer análises do arquivo usado na 1a semana da aulas em outro programa (outro pacote do R ou outro software) | ||
| + | * Alunos estatística (compulsório) / outros cursos (opcional) | ||
| + | * Escrever verossimilhança para estimar parâmetros com variâncias diferentes em diferentes áreas | ||
| + | * Escrever verossimilhança o modelo básico com uma função de correlação de suporte compacto (alcance finito) utilizando algoritmos de matrizes esparsas para operar com a matriz de covariâncias (ver pacote ''sparseM'') | ||
| + | * Verossimilhança para distribuição t-multivariada | ||
| + | * Verossimilhança composta (Naimara) | ||
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| + | ==== Semana 3 ==== | ||
| + | * 04/10 | ||
| + | * Manhã: | ||
| + | * Anisotropia e estacionaridade - extensões do modelo | ||
| + | * Predicões e simulações condicionais | ||
| + | * Predicao de funcionais | ||
| + | * {{:disciplinas:geoesalq:pira2012:comandosintro.r|arquivo de comandos}} básico do curso foi atualizado | ||
| * Tarde | * Tarde | ||
| - | * {{:disciplinas:geoesalq:intro-simula.r|Um arquivo de comandos}} com exemplos introdutórios de simulação no R (modelos **não** espaciais) | + | * Discussão e temas variados |
| - | * {{:disciplinas:geoesalq:simular.r|arquivo 3}} | + | * Aula interrompida devido à falta de energia elétrica |
| - | * {{:disciplinas:geoesalq:comandos-simula.r|arquivo 2}} simulações do modelo geoestatístico básico no R, feitas de várias formas | + | |
| - | * {{:disciplinas:geoesalq:grftutorial.r|arquivo de comandos 1}} Um breve tutorial de uso da função ''grf()'' | + | * 05/10 |
| - | * {{:disciplinas:geoesalq:simular-glgm.r|arquivo 5}} Simulação de modelos GLM geoestatísticos (Poisson e Binomial) | + | * Manhã: Representaçao e dados espaciais |
| - | * Definir e montar um conjunto de simulações. Montar o seu arquivo de comandos. | + | - Convertendo um objeto de áreas/polígonos em geodata (centroides como coordenadas) |
| + | * {{:disciplinas:geoesalq:area2geo.r|arquivo de comandos}} | ||
| + | * Arquivos shapefile {{:disciplinas:cieg:bairros.shp|}} {{:disciplinas:cieg:bairros.shx|}} {{:disciplinas:cieg:bairros.dbf|}} | ||
| + | * {{:disciplinas:cieg:tabe.csv|Atributos dos bairros}} | ||
| + | - Montar geodata a partir da importação de dados de centroides de municípios do Paraná | ||
| + | * shape com o estado do PR ({{:disciplinas:geoesalq:41uf2500g.dbf|arquivo dbf}}, {{:disciplinas:geoesalq:41uf2500g.shp|arquivo shp}}, {{:disciplinas:geoesalq:41uf2500g.shx|arquivo shx}}) | ||
| + | * shape com os municípios do PR ({{:disciplinas:geoesalq:41mu2500g.dbf|arquivo dbf}}, {{:disciplinas:geoesalq:41mu2500g.shp|arquivo shp}}, {{:disciplinas:geoesalq:41mu2500g.shx|arquivo shx}}) | ||
| + | * {{:disciplinas:geoesalq:prodsoja.txt|arquivo de atributos}} | ||
| + | * {{:disciplinas:geoesalq:rotina.r|Script de análise}} | ||
| + | * Tarde: | ||
| + | * Inferência e predição Bayesiana | ||
| + | * {{:disciplinas:geoesalq:pira2012:comandosintro.r|arquivo de comandos}} básico do curso foi atualizado | ||
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| + | ==== Semana 3 ==== | ||
| + | * 04/10 | ||
| + | * Manhã: | ||
| + | * Revisão GLM. Simulações do GLM/GLGM | ||
| + | * {{:disciplinas:geoesalq:sim-glgm.r|arquivo de comandos}} de simulações | ||
| + | * {{:disciplinas:geoesalq:simular-glgm.r|Simulação de modelos GLM geoestatísticos}}(Poisson e Binomial) | ||
| + | * Análises usando a geoRglm: | ||
| + | * {{:disciplinas:geoesalq:poisson-sim.r|Análise com o modelo Poisson geoestatístico}} | ||
| + | * {{:disciplinas:geoesalq:binario-1d.r|arquivo com código}} para exemplo de simulação e análise de dados binários em 1-D | ||
| + | * {{:disciplinas:geoesalq:simbin.txt|arquivo de dados binários}} para análise com geoRglm | ||
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| Linha 540: | Linha 648: | ||
| * {{disciplinas:ce714:r:aula3pira.r|Arquivo com comandos do R}} com análise geoestatística utilizados durante aula | * {{disciplinas:ce714:r:aula3pira.r|Arquivo com comandos do R}} com análise geoestatística utilizados durante aula | ||
| * outro {{disciplinas:ce714:r:aula4pira.r|arquivo com comandos do R}} com análise geoestatística utilizados durante aula | * outro {{disciplinas:ce714:r:aula4pira.r|arquivo com comandos do R}} com análise geoestatística utilizados durante aula | ||
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