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Diferenças
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projetos:apspcs [2008/08/25 10:15] joel |
projetos:apspcs [2009/01/02 11:19] (atual) joel |
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Linha 1: | Linha 1: | ||
===== Participantes ===== | ===== Participantes ===== | ||
- | - [[pessoais:kelly|Kelly Cristina Cancela]], Mestranda (UFPR) | + | - [[pessoais:kelly|Kelly Cristina Cancela]], Mestre(UFPR) |
- Antonio Rioyei Higa, Prof. Phd | - Antonio Rioyei Higa, Prof. Phd | ||
- [[pessoais:joel|Joel Maurício Corrêa da Rosa]] , Prof. Dr. (UFPR) | - [[pessoais:joel|Joel Maurício Corrêa da Rosa]] , Prof. Dr. (UFPR) | ||
- [[pessoais:lucianads|Luciana Duque Silva]] ,Doutoranda (UFPR) | - [[pessoais:lucianads|Luciana Duque Silva]] ,Doutoranda (UFPR) | ||
+ | - [[pessoais:valdeci|Valdeci Constantino]] ,Mestrando (UFPR) | ||
===== Objetivo ===== | ===== Objetivo ===== | ||
Linha 56: | Linha 57: | ||
{{:pessoais:lduque:dadoslucianaduqueinclinacao.csv|Dados do Dendrômetro}} | {{:pessoais:lduque:dadoslucianaduqueinclinacao.csv|Dados do Dendrômetro}} | ||
- | |||
- | <code> | ||
- | |||
- | Welch Two Sample t-test | ||
- | |||
- | data: Inclinacao by factor(Familia) | ||
- | t = 3.3352, df = 237.873, p-value = 0.0009887 | ||
- | alternative hypothesis: true difference in means is not equal to 0 | ||
- | 95 percent confidence interval: | ||
- | 0.02653859 0.10312808 | ||
- | sample estimates: | ||
- | mean in group 11 mean in group 24 | ||
- | 0.3349167 0.2700833 | ||
- | |||
- | t.test(Inclinacao[meis==1]~Familia[meis==1]) | ||
- | |||
- | Welch Two Sample t-test | ||
- | |||
- | data: Inclinacao[meis == 1] by Familia[meis == 1] | ||
- | t = 0.4278, df = 17.553, p-value = 0.674 | ||
- | alternative hypothesis: true difference in means is not equal to 0 | ||
- | 95 percent confidence interval: | ||
- | -0.1215350 0.1835350 | ||
- | sample estimates: | ||
- | mean in group 11 mean in group 24 | ||
- | 0.505 0.474 | ||
- | |||
- | > t.test(Inclinacao[meis==2]~Familia[meis==2]) | ||
- | |||
- | Welch Two Sample t-test | ||
- | |||
- | data: Inclinacao[meis == 2] by Familia[meis == 2] | ||
- | t = 1.0119, df = 17.996, p-value = 0.325 | ||
- | alternative hypothesis: true difference in means is not equal to 0 | ||
- | 95 percent confidence interval: | ||
- | -0.08179697 0.23379697 | ||
- | sample estimates: | ||
- | mean in group 11 mean in group 24 | ||
- | 0.347 0.271 | ||
- | |||
- | > t.test(Inclinacao[meis==3]~Familia[meis==3]) | ||
- | |||
- | Welch Two Sample t-test | ||
- | |||
- | data: Inclinacao[meis == 3] by Familia[meis == 3] | ||
- | t = 1.021, df = 17.133, p-value = 0.3215 | ||
- | alternative hypothesis: true difference in means is not equal to 0 | ||
- | 95 percent confidence interval: | ||
- | -0.07349969 0.21149969 | ||
- | sample estimates: | ||
- | mean in group 11 mean in group 24 | ||
- | 0.298 0.229 | ||
- | |||
- | > t.test(Inclinacao[meis==4]~Familia[meis==4]) | ||
- | |||
- | Welch Two Sample t-test | ||
- | |||
- | data: Inclinacao[meis == 4] by Familia[meis == 4] | ||
- | t = 1.605, df = 17.661, p-value = 0.1262 | ||
- | alternative hypothesis: true difference in means is not equal to 0 | ||
- | 95 percent confidence interval: | ||
- | -0.02796802 0.20796802 | ||
- | sample estimates: | ||
- | mean in group 11 mean in group 24 | ||
- | 0.301 0.211 | ||
- | |||
- | > t.test(Inclinacao[meis==5]~Familia[meis==5]) | ||
- | |||
- | Welch Two Sample t-test | ||
- | |||
- | data: Inclinacao[meis == 5] by Familia[meis == 5] | ||
- | t = 0.6314, df = 17.51, p-value = 0.5359 | ||
- | alternative hypothesis: true difference in means is not equal to 0 | ||
- | 95 percent confidence interval: | ||
- | -0.09336618 0.17336618 | ||
- | sample estimates: | ||
- | mean in group 11 mean in group 24 | ||
- | 0.327 0.287 | ||
- | |||
- | |||
- | t.test(Inclinacao[meis==6]~Familia[meis==6]) | ||
- | |||
- | Welch Two Sample t-test | ||
- | |||
- | data: Inclinacao[meis == 6] by Familia[meis == 6] | ||
- | t = 1.6165, df = 17.785, p-value = 0.1236 | ||
- | alternative hypothesis: true difference in means is not equal to 0 | ||
- | 95 percent confidence interval: | ||
- | -0.03188598 0.24388598 | ||
- | sample estimates: | ||
- | mean in group 11 mean in group 24 | ||
- | 0.422 0.316 | ||
- | |||
- | > t.test(Inclinacao[meis==7]~Familia[meis==7]) | ||
- | |||
- | Welch Two Sample t-test | ||
- | |||
- | data: Inclinacao[meis == 7] by Familia[meis == 7] | ||
- | t = 1.2701, df = 16.575, p-value = 0.2216 | ||
- | alternative hypothesis: true difference in means is not equal to 0 | ||
- | 95 percent confidence interval: | ||
- | -0.04252069 0.17052069 | ||
- | sample estimates: | ||
- | mean in group 11 mean in group 24 | ||
- | 0.342 0.278 | ||
- | |||
- | > t.test(Inclinacao[meis==8]~Familia[meis==8]) | ||
- | |||
- | Welch Two Sample t-test | ||
- | |||
- | data: Inclinacao[meis == 8] by Familia[meis == 8] | ||
- | t = 2.1657, df = 17.891, p-value = 0.04409 | ||
- | alternative hypothesis: true difference in means is not equal to 0 | ||
- | 95 percent confidence interval: | ||
- | 0.003334605 0.222665395 | ||
- | sample estimates: | ||
- | mean in group 11 mean in group 24 | ||
- | 0.375 0.262 | ||
- | |||
- | > t.test(Inclinacao[meis==9]~Familia[meis==9]) | ||
- | |||
- | Welch Two Sample t-test | ||
- | |||
- | data: Inclinacao[meis == 9] by Familia[meis == 9] | ||
- | t = 2.7336, df = 17.958, p-value = 0.01366 | ||
- | alternative hypothesis: true difference in means is not equal to 0 | ||
- | 95 percent confidence interval: | ||
- | 0.02729578 0.20870422 | ||
- | sample estimates: | ||
- | mean in group 11 mean in group 24 | ||
- | 0.207 0.089 | ||
- | |||
- | > t.test(Inclinacao[meis==10]~Familia[meis==10]) | ||
- | |||
- | Welch Two Sample t-test | ||
- | |||
- | data: Inclinacao[meis == 10] by Familia[meis == 10] | ||
- | t = 0.2025, df = 17.497, p-value = 0.8418 | ||
- | alternative hypothesis: true difference in means is not equal to 0 | ||
- | 95 percent confidence interval: | ||
- | -0.0939401 0.1139401 | ||
- | sample estimates: | ||
- | mean in group 11 mean in group 24 | ||
- | 0.331 0.321 | ||
- | |||
- | > t.test(Inclinacao[meis==11]~Familia[meis==11]) | ||
- | |||
- | Welch Two Sample t-test | ||
- | |||
- | data: Inclinacao[meis == 11] by Familia[meis == 11] | ||
- | t = 0.5754, df = 17.598, p-value = 0.5723 | ||
- | alternative hypothesis: true difference in means is not equal to 0 | ||
- | 95 percent confidence interval: | ||
- | -0.07972366 0.13972366 | ||
- | sample estimates: | ||
- | mean in group 11 mean in group 24 | ||
- | 0.246 0.216 | ||
- | |||
- | > t.test(Inclinacao[meis==12]~Familia[meis==12]) | ||
- | |||
- | Welch Two Sample t-test | ||
- | |||
- | data: Inclinacao[meis == 12] by Familia[meis == 12] | ||
- | t = 0.5083, df = 17.923, p-value = 0.6175 | ||
- | alternative hypothesis: true difference in means is not equal to 0 | ||
- | 95 percent confidence interval: | ||
- | -0.09717278 0.15917278 | ||
- | sample estimates: | ||
- | mean in group 11 mean in group 24 | ||
- | 0.318 0.287 | ||
- | |||
- | > t.test(Inclinacao~factor(Familia)) | ||
- | </code> | ||
Joel, estou enviando o arquivo com os dados para determinar as correlações existentes entre as inclinações diárias e os dados meteorológicos do ano de 2007. Neste arquivo tem duas planilhas, uma somente com os dados do ano de 2007 e a outra com os dados de 2007 e algumas informações de dezembro de 2006 para determinar as correlações com os dados meteorológicos dos meses anteriores. Qualquer dúvida me escreva. | Joel, estou enviando o arquivo com os dados para determinar as correlações existentes entre as inclinações diárias e os dados meteorológicos do ano de 2007. Neste arquivo tem duas planilhas, uma somente com os dados do ano de 2007 e a outra com os dados de 2007 e algumas informações de dezembro de 2006 para determinar as correlações com os dados meteorológicos dos meses anteriores. Qualquer dúvida me escreva. | ||
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Definir alguns contrastes de interesse (Por exemplo: média dos tubetes x raiz nua) | Definir alguns contrastes de interesse (Por exemplo: média dos tubetes x raiz nua) | ||
+ | |||
+ | {{:projetos:apspcs:resultadospreliminarescapitulo1.doc|Resultados Preliminares do Capítulo 1 }} | ||
==== Capítulo 2 ==== | ==== Capítulo 2 ==== | ||
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No capítulo 3 foram amostradas, de maneira destrutiva, todas as árvores do primeiro bloco e cada ávore foi fotografada de 3 ângulos diferentes. Em cada ângulo, serão avaliadas as características da raiz grossa de acordo com escores pré-determinados. 64 árvores no total. | No capítulo 3 foram amostradas, de maneira destrutiva, todas as árvores do primeiro bloco e cada ávore foi fotografada de 3 ângulos diferentes. Em cada ângulo, serão avaliadas as características da raiz grossa de acordo com escores pré-determinados. 64 árvores no total. | ||
- | A variável resposta é multivariada categórica. A princípio um vetor de dimensão 3 com os 3 escores para os ângulos fotografados. | + | * A variável resposta é multivariada qualitativa ordinal. A princípio um vetor de dimensão 3 com os 3 escores para os ângulos fotografados. |
+ | * Fatores de variação: Responsável pelo plantio (E - Empresa , T - Terceirizado), Sistema de produção de mudas (tubete/55cm3 com 6 meses, tubete/55cm3 com 10 meses, tubete/126cm3 com 6 meses, raiz nua). Covariável : Número de mortos na vizinhança, posição do morto na vizinhança , | ||
Linha 314: | Linha 145: | ||
Uma possibilidade (mais pobre) é aplicar testes não paramétricos para a nota em cada ângulo fotografado. | Uma possibilidade (mais pobre) é aplicar testes não paramétricos para a nota em cada ângulo fotografado. | ||
+ | |||
+ | Neste capítulo, a primeira abordagem estatística consiste de utilizar uma técnica não paramétrica para encontrar alguma evidência de diferença entre os métodos e entre as empresas na constituição da raiz grossa. A justificativa para utilizar técnicas não-paramétricas é a característica da variável resposta que é qualitativa. | ||
+ | |||
+ | |||
+ | <code> | ||
+ | # Leitura dos dados | ||
+ | avalia<-read.csv2('http://www.leg.ufpr.br/~joel/dados/grossaclassif.csv') | ||
+ | # Resumo das variaveis | ||
+ | summary(avalia) | ||
+ | # Attachando os dados | ||
+ | attach(avalia) | ||
+ | # Nomes das variaveis | ||
+ | names(avalia) | ||
+ | # Carrega pacote para comparacoes multiplas nao parametricas | ||
+ | require(pgirmess) | ||
+ | |||
+ | # O gráfico de interacao é fundamental pois vai ser um instrumento para verificar | ||
+ | # a sua possivel existencia | ||
+ | |||
+ | interaction.plot(metodo,plantio,soma) | ||
+ | interaction.plot(plantio,metodo,soma) | ||
+ | |||
+ | # Alguns graficos exploratorios para entender melhor as interacoes | ||
+ | boxplot(soma[plantio=="empresa"]~metodo[plantio=="empresa"]) | ||
+ | boxplot(soma[plantio=="terceiro"]~metodo[plantio=="terceiro"]) | ||
+ | |||
+ | boxplot(soma[metodo=="M1"]~plantio[metodo=="M1"]) | ||
+ | boxplot(soma[metodo=="M2"]~plantio[metodo=="M2"]) | ||
+ | boxplot(soma[metodo=="M3"]~plantio[metodo=="M3"]) | ||
+ | boxplot(soma[metodo=="M4"]~plantio[metodo=="M4"]) | ||
+ | |||
+ | |||
+ | # Testes para verificar diferenças nos plantios dentro dos métodos | ||
+ | # Observação : como são dois niveis de plantio, o teste U de Mann-Whitney é um caso | ||
+ | # particular do kruskall-wallis e , portanto, não precisa fazer comparação multipla aqui | ||
+ | |||
+ | # Nomes dos metodos | ||
+ | m<-levels(metodo) | ||
+ | |||
+ | # loop que troca de metodos e testa diferencas entre os plantios | ||
+ | for (i in 1:4) | ||
+ | { | ||
+ | s<-soma[metodo==m[i]] | ||
+ | p<-plantio[metodo==m[i]] | ||
+ | print(paste("metodo",m[i])) | ||
+ | print(kruskal.test(s~p)) | ||
+ | } | ||
+ | |||
+ | |||
+ | # aqui vamos trocar de plantios e verificar as diferenças entre os métodos | ||
+ | n<-levels(plantio) | ||
+ | |||
+ | # loop que troca de plantios e testa as diferenças entre os métodos...aqui | ||
+ | # já aproveito o embalo e faço as comparações multiplas com nível de significância | ||
+ | # de 10% | ||
+ | |||
+ | for (i in 1:2) | ||
+ | { | ||
+ | s<-soma[plantio==n[i]] | ||
+ | p<-metodo[plantio==n[i]] | ||
+ | print(paste("plantio",n[i])) | ||
+ | print(kruskal.test(s~p)) | ||
+ | print(kruskalmc(s,p,prob=0.1)) | ||
+ | } | ||
+ | |||
+ | |||
+ | </code> | ||
==== To Do List ==== | ==== To Do List ==== | ||
- | * Colocar as planilhas para os Capítulos 1 e 2 (Valdeci) | + | * Criar e preencher as planilhas para os Capítulos 1 e 2 (Valdeci) |
===== Artigos de Interesse ===== | ===== Artigos de Interesse ===== |