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Diferenças

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disciplinas:ce225-2012-02:historico [2013/02/27 17:37]
paulojus
disciplinas:ce225-2012-02:historico [2013/03/04 08:00]
paulojus
Linha 32: Linha 32:
 | 22/02 |atividades de estudo (ver abaixo) |  |   ​| ​ |  | | | |  ​ | 22/02 |atividades de estudo (ver abaixo) |  |   ​| ​ |  | | | |  ​
 | 27/02 |PA-03. Outros GLM's - estendendo GLM usuais - modelos com dispersão, modelagem de média e variância, quasi verosimilhança,​ superdispersão e efeitos eleatórios| ​ |   ​| ​ |  | | | |  ​ | 27/02 |PA-03. Outros GLM's - estendendo GLM usuais - modelos com dispersão, modelagem de média e variância, quasi verosimilhança,​ superdispersão e efeitos eleatórios| ​ |   ​| ​ |  | | | |  ​
-| 01/03 | LABEST - exemplos de "​outros"​ GLM'​s| ​ |   ​| ​ |  | | | |  ​+| 01/03 | LABEST - exemplos de "​outros"​ GLM's. Ex: Escolha da modelo, modelo binomial negativo e quasipoisson (ver abaixo)|  |   ​| ​ |  | | | |  ​
  
  
Linha 362: Linha 362:
       - como calcular os valores da curva de valores ajustados nos exemplos da //​creatinina vs infarto// e no de "novos casos de AIDS na Bélgica"​. Ainda neste exemplo, como estimar a dose associada a uma certa probabilidade fixada de morte?       - como calcular os valores da curva de valores ajustados nos exemplos da //​creatinina vs infarto// e no de "novos casos de AIDS na Bélgica"​. Ainda neste exemplo, como estimar a dose associada a uma certa probabilidade fixada de morte?
       - como calcular as contagens esperadas no exemplo de //crença vc sexo" ?       - como calcular as contagens esperadas no exemplo de //crença vc sexo" ?
 +
 +=== 01/03 ===
 +<code R>
 +## carregando o conjunto de dados DHF99 do pacote epicalc
 +require(epicalc)
 +data(DHF99)
 +head(DHF99)
 +help(DHF99)
 +summary(DHF99)
 +summary(DHF99)
 +## a variável village está como numérica mas de fato é um fator
 +DHF99$village <- as.factor(DHF99$village)
 +summary(DHF99)
 +##
 +## Ajustando GLM's
 +glm1 <- glm(containers ~ village + education, data=DHF99, family=poisson)
 +glm1
 +summary(glm1)
 +anova(glm1)
 +##
 +## vamos usar agora apenas a informação do tipo de vila
 +glm2 <- glm(containers ~ viltype + education, data=DHF99, family=poisson)
 +glm2
 +summary(glm1)
 +anova(glm1)
 +##
 +## comparando os ajustes
 +anova(glm2, glm1, test="​Chisq"​)
 +## Portanto a informação individual de cada vila é relevante.
 +## Entretanto, como exemplo vamos supor que não dispomos da informação individual
 +## e apenas o tipo de vila.
 +## Neste caso o ajuste não é bom e vamos tentar alternativas
 +## 1. Modelo com interação
 +glm3 <- glm(containers ~ viltype * education, data=DHF99, family=poisson)
 +anova(glm2, glm3, test="​Chisq"​)
 +anova(glm2, glm3, test="​F"​)
 +## 2. Modelo Binomial negativo
 +require(MASS)
 +glm2BN <- glm.nb(containers ~ viltype + education, data=DHF99)
 +glm2BN
 +c(poisson=logLik(glm2),​ BN=logLik(glm2BN))
 +c(poisson=deviance(glm2),​ BN=deviance(glm2BN))
 +c(poisson=AIC(glm2),​ BN=AIC(glm2BN))
 +## comparando os coeficientes e erros padrão
 +summary(glm2)
 +summary(glm2BN)
 +## 3. Modelo quasipoisson
 +glm2Q <- glm(containers ~ viltype + education, data=DHF99, family=quasipoisson)
 +## comparando os coeficientes e erros padrão
 +summary(glm2)
 +summary(glm2Q)
 +## Note que os ajustes poderiam ser avaliados em mais detalhes
 +par(mfrow=c(2,​2))
 +plot(glm1)
 +plot(glm2)
 +plot(glm3)
 +plot(glm2BN)
 +##
 +## As análises poderiam prosseguir ​
 +## - avaliando ainda outros modelos como por exemplo inflacionados de de zeros, hurdle .
 +## - verificando a relevância das covariáveis (e.g education)
 +## - Caso as vilas fossem consideradas poderia-se avaliar modelos mistos como vilas como efeito aleatórios
 +</​code>​
 +

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