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Diferenças

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disciplinas:ce225-2012-02:historico [2013/02/07 17:16]
paulojus
disciplinas:ce225-2012-02:historico [2013/02/27 17:27]
paulojus
Linha 28: Linha 28:
 | 01/02 | LABEST (VER ABAIXO) |Interpretações de resultados das análises ​  ​| ​  ​| ​ |  | | | |  ​ | 01/02 | LABEST (VER ABAIXO) |Interpretações de resultados das análises ​  ​| ​  ​| ​ |  | | | |  ​
 | 06/02 | PA-03 (VER ABAIXO)|Testes de hipótese em GLM e tipos de resíduos, com ênfase em de Pearson e de Deviance ​ |   ​| ​ |  | | | |  ​ | 06/02 | PA-03 (VER ABAIXO)|Testes de hipótese em GLM e tipos de resíduos, com ênfase em de Pearson e de Deviance ​ |   ​| ​ |  | | | |  ​
-08/02 | LABEST (VER ABAIXO) |  |   ​| ​ |  | | | |  ​+15/02 | LABEST ​Análise de tabelas de contingência. Distribuições e modelos alternativos e equivalências em análise ​ via GLM|  |   ​| ​ |  | | | |   
 +| 20/02 |atividades de estudo ​(ver abaixo|  |   ​| ​ |  | | | |   
 +| 22/02 |atividades de estudo (ver abaixo) |  |   ​| ​ |  | | | |   
 +| 27/02 |PA-03. Outros GLM's - estendendo GLM usuais - modelos com dispersão, modelagem de média e variância, quasi verosimilhança,​ superdispersão e efeitos eleatórios| ​ |   ​| ​ |  | | | |   
 +| 01/03 | LABEST - exemplos de "​outros"​ GLM's|  |   ​| ​ |  | | | |  ​
  
  
Linha 213: Linha 217:
  
 ==== 06/02 e 08/02 ==== ==== 06/02 e 08/02 ====
 +**Exemplo 1** \\
 A tabela abaixo apresenta dados de um estudo sobre "​Acreditar em Vida Após a Morte" retirados de Wood (2006). A tabela abaixo apresenta dados de um estudo sobre "​Acreditar em Vida Após a Morte" retirados de Wood (2006).
 O interesse aqui é utilizar estes dados para investigar se a crença está associada com o sexo. O interesse aqui é utilizar estes dados para investigar se a crença está associada com o sexo.
Linha 229: Linha 233:
 </​code>​ </​code>​
  
 +<code R>
 +
 +M <- cbind(c(435,​ 375), c(147, 134))
 +dimnames(M) <- list(c("​F",​ "​M"​),​ c("​S",​ "​N"​))
 +M
 +
 +chisq.test(M)
 +
 +addmargins(M)
 +Mesp <- outer(rowSums(M),​ colSums(M))/​sum(M)
 +Mesp
 +
 +(Chi2 <- sum(((M - Mesp)^2)/​Mesp))
 +chisq.test(M,​ correct=F)
 +
 +
 +vam <- data.frame(Y=as.vector(M),​ Sexo = rownames(M),​ Acredita=rep(colnames(M),​ each=2))
 +vam
 +
 +## Modelo 0
 +
 +## Modelo 1: (independência)
 +## E(Y) = mu = n * Sexo * Acredita ​
 +## log(mu) ​ = log(n) + log(Sexo) + log(Acredita) ​
 +mod1 <- glm(Y ~ Sexo + Acredita, family=poisson(link="​log"​),​ data=vam)
 +model.matrix(mod1)
 +mod1
 +
 +fitted(mod1)
 +Mesp
 +
 +resid(mod1, type="​pearson"​)
 +(M - Mesp)/​sqrt(Mesp)
 +
 +sum(resid(mod1,​ type="​pearson"​)^2)
 +
 +
 +resid(mod1, type="​deviance"​)
 +sum(resid(mod1,​ type="​deviance"​)^2)
 +
 +
 +## Modelo 2: não independência
 +mod2 <- glm(Y ~ Sexo * Acredita, family=poisson,​ data=vam)
 +model.matrix(mod2)
 +mod2
 +
 +fitted(mod2)
 +M
 +
 +anova(mod1, mod2, test="​Chisq"​)
 +
 +## extensível a várias dimensões - modelos log-lineares
 +
 +# sob link canônico X'y = X'​\hat{mu}
 +#  - marginais preditas iguais a observadas em mod1
 +</​code>​
 +
 +
 +**Exemplo 2**\\
 +Novos casos de AIDS na Bélgica de 1981 a 1993.\\
 +Modelo Epidêmico (Venables & Ripley, MASS). \\
 +//​Interesse://​ A taxa de novos casos está reduzindo?
 +
 +<code R>
 +aids <- data.frame(
 +        y = c(12,​14,​33,​50,​67,​74,​123,​141,​165,​204,​253,​246,​240),​
 +        ano = 1:13
 +)
 +aids
 +with(aids, plot(y ~ I(1980 + ano)))
 +</​code>​
 +
 +Considere um modelo em que o número esperado de novos casos por ano seja:
 +<​latex>​
 +\mu_i = \gamma \exp(\delta t_i)
 +</​latex>​
 +
 +Ajuste o modelo fazendo suposições necessárias e adequadas.\\
 +Procure avaliar a qualidade de ajuste e possíveis formas de tentar melhorar o ajuste com os dados disponíveis.\\
 +Represente o(s) modelo(s) ajustados graficamente (na escala das observações) procurando incluir no gráfico a incerteza das previsões
 +
 +<code R>
 +# mu_i = a . exp(b*ano_i)
 +# log(mu_i) = log(a) +  b*ano_i ​ = \beta_0 +  \beta_1 * ano_i
 +
 +m1 <- glm(y ~ ano, family=poisson,​ data=aids) ​
 +m1
 +summary(m1)
 +
 +plot(resid(m1) ~fitted(m1))
 +lines(lowess(resid(m1) ~fitted(m1)))
 +
 +par(mfrow=c(2,​2))
 +plot(m1)
 +par(mfrow=c(1,​1))
 +
 +## tentando melhorar o ajuste
 +m2 <- glm(y ~ ano + I(ano^2), family=poisson,​ data=aids) ​
 +m2
 +summary(m2)
 +anova(m1,​m2,​ test="​Chisq"​)
 +
 +# nao faz sentido aqui mas é util com variaveis diferentes ​
 +drop1(m2)
 +drop1(m2, test="​Chisq"​)
 +
 +ano.seq <- seq(1,13, l=100)
 +ypred <- predict(m2, data.frame(ano=ano.seq),​ se=TRUE)
 +str(ypred)
 +with(aids, plot(y ~ I(1980 + ano), ylim=c(0,​280)))
 +lines(exp(ypred$fit) ~ I(ano.seq+1980))
 +lines(exp(ypred$fit - 2*ypred$se.fit) ~ I(ano.seq+1980),​ lty=2)
 +lines(exp(ypred$fit + 2*ypred$se.fit) ~ I(ano.seq+1980),​ lty=2)
 +</​code>​
 +.
 +  ​

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