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Diferenças
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dicas:ccad [2010/07/23 18:47] paulojus |
dicas:ccad [2011/10/07 11:32] (atual) paulojus |
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| Linha 20: | Linha 20: | ||
| * O usuário cadastrado receberá email com login e senha de acesso. | * O usuário cadastrado receberá email com login e senha de acesso. | ||
| * o acesso deve ser feito sempre à servidora ''ccad.ufpr.br'' | * o acesso deve ser feito sempre à servidora ''ccad.ufpr.br'' | ||
| - | * a partir desta servidora é possível acessar as demais máquinas do LCPAD via o comando ''rlogin'' (mais detalhes abaixo) | ||
| * O acesso à servidora ''ccad.ufpr.br'' pode ser feito por ''ssh'' (inclusive gráfico com ''ssh -X'') via programa gráfico de ssh (putty, etc) ou linha de comando com:<code> | * O acesso à servidora ''ccad.ufpr.br'' pode ser feito por ''ssh'' (inclusive gráfico com ''ssh -X'') via programa gráfico de ssh (putty, etc) ou linha de comando com:<code> | ||
| $ ssh LOGIN@ccad.ufpr.br</code> | $ ssh LOGIN@ccad.ufpr.br</code> | ||
| Linha 79: | Linha 78: | ||
| #PBS -m ae | #PBS -m ae | ||
| #PBS -M paulojus@leg.ufpr.br | #PBS -M paulojus@leg.ufpr.br | ||
| + | #PBS -l walltime=6:00:00 | ||
| cd $PBS_O_WORKDIR | cd $PBS_O_WORKDIR | ||
| Linha 85: | Linha 85: | ||
| ccad:~> qsub run.sh </code> | ccad:~> qsub run.sh </code> | ||
| - Monitorar o progresso com<code> | - Monitorar o progresso com<code> | ||
| - | ccad:~> qstat run.sh</code> | + | ccad:~> qstat </code> |
| - E também monitorar da forma usual o arquivo de saída do R<code> | - E também monitorar da forma usual o arquivo de saída do R<code> | ||
| ccad:~> tail -f seu_programa.Rout | ccad:~> tail -f seu_programa.Rout | ||
| Linha 98: | Linha 98: | ||
| === Tempo de processamento === | === Tempo de processamento === | ||
| - | Por //default// o CCAD interrompe os processos após uma (1) hora de provessamento. | + | Por //default// o CCAD interrompe os processos após uma (1) hora de processamento. |
| - | Para aumentar este tempo, por exemplo para seis (6) horas, inclua no seu arquivo: | + | No exemplo de arquivo ''run.sh'' acima já modificamos |
| + | este tempo, para seis (6) horas, incluindo no seu arquivo: | ||
| #PBS -l walltime=6:00:00 | #PBS -l walltime=6:00:00 | ||
| + | Ajuste este tempo de acordo com a sua necessidade. | ||
| === Pacotes do R === | === Pacotes do R === | ||
