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cursos:rlavras:compilado [2008/11/02 12:54] paulojus criada |
cursos:rlavras:compilado [2008/11/02 13:33] paulojus |
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====== Interface do R com códigos compilados ====== | ====== Interface do R com códigos compilados ====== | ||
- | * {{:cursos:rlavras:clavras01.c|}} | + | Nas instruções a seguir os comandos precedidos de ''$'' devem ser digidados na linha de comando do Linux (ou análogo em outro sistema operacional), e os precedidos por ''>'' devem ser digitados no R. |
- | * {{:cursos:rlavras:clavras02.c|}} | + | |
+ | Códigos escritos e compilados em linguagens ''C'', ''C + +'' ou ''Fortran'' podem ser chamados de dentro do R conforme ilustramos nos exemplos a seguir. Os passos básicos para tal procedimento são: | ||
+ | - Escrever o código na linguagem desejada (''C'', ''C + +'' ou ''Fortran'') | ||
+ | - Compilar o código como o comando do linux (no Windows deve-se usar um comando análogo) <code bash>$ R CMD SHLIB</code> | ||
+ | - Carregar o código compilado no R com o comando <code R>> dyn.load()</code> | ||
+ | - Usar a(s) função(ões) do código compilado com os comandos ''.C()'', ''.Call()'' ou ''.Fortran()''. | ||
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+ | ==== Exemplo 1 ==== | ||
+ | Considere escrever uma função em ''C'' para calcular valores da função de correlação de Matèrn. Esta função tem como argumento ''u'' e parâmetros <latex>$(\phi, \kappa)$</latex> e é dada pela seguinte expressão:\\ | ||
+ | <latex>$\rho(u) = \{2^{\kappa-1} \Gamma(\kappa)\}^{-1} (u/\phi)^\kappa K_\kappa(u/\phi).$</latex> | ||
+ | No arquivo {{:cursos:rlavras:clavras01.c|}} encontra-se um código ''C'' para calcular valores de uma versão padronizada desta função onde <latex>$\phi=1$</latex>. | ||
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+ | ==== Exemplo 2 ==== | ||
+ | Considere agora uma extensão do exemplo anterior onde temos mais de um arquivo de código. Além do arquivo com código C anterior considere também o arquivo {{:cursos:rlavras:clavras02.c|}} onde mais duas rotinas em | ||
* {{:cursos:rlavras:clavras.r|}} | * {{:cursos:rlavras:clavras.r|}} | ||