====== Análise Estatística em Ambiente R ======
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==== Descrição ====

Curso ministrado pelo Professor M.Sc. [[http://www.leg.ufpr.br/doku.php/pessoais:walmes|Walmes Marques Zeviani]] acadêmicos do Curso de Especialização em Instrumentação Estatística da UNOCHAPECÓ em Chapecó - SC. O Curso tem o objetivo de apresentar o programa R e sua aplicação na análise de dados. O Curso será ministrado nos dias 01-02/06 e 15-16/06 de 2012 nas dependencias da UNOCHAPECÓ.

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==== Ementa do Curso ====

  * Instalação e documentação do programa;
  * Interfaces para uso do R;
  * Introdução à análise de dados no ambiente de computação estatística R.
  * Tipos de objetos, funções e pacotes.
  * Importação e exportação de dados.
  * Análise gráfica exploratória.
  * Procedimentos de estimação e testes de hipótese;
  * Ajuste de modelos de regressão;
  * Geração automática de relatório.

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==== Justificativa ====

A análise de dados é uma parte fundamental do processo de tomada de decisão. Nos dias atuais, a quantidade de dados disponível e a velocidade com que as decisões devem ser tomadas exigem o emprego de recursos computacionais. O ambiente R de computação estatística é um software livre e o conhecimento com relação ao uso desse aplicativo é um diferencial para a formação de profissionais situados entre as mais diversas áreas do conhecimento.

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==== Objetivo ====

Capacitar os participantes a realizar análise estatística por meio do  ambiente R.

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==== Conteúdo programático ====

Instação do R e Rstudio. Componentes da interface do programa. Acesso à documentação do programa. Criação e modificação de objetos. Criação e uso de funções. Instalação e uso de pacotes. Importação e exportação de dados em formato texto e planilha. Análise gráfica exploratória. Teste de hipótese e intervalos de confiança. Ajuste de modelos de regressão linear e não linear. Análise de experimentos. Introdução à geração automática de relatórios.

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==== Metodologia de ensino ====

Aula expositiva com recusos multimídia.

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==== Avaliação ====

Relatório com a análise completa e interpretação de resultados para um conjunto de dados.

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==== Referências ====

  * RIBEIRO JÚNIOR, P. J. Introdução ao Ambiente Estatístico R. disponível em: http://www.leg.ufpr.br/doku.php/software:material-r. 2010.
  * DALGAARD, Peter. Introductory Statistics with R (2nd ed.) Springer. 2008
  * VERZANI, John. Using R for Introductory Statistics. Chapman & Hall/CRC, Boca Raton, FL, 2005.
  * RIZZO, Maria L. Statistical Computing with R. Chapman & Hall/CRC, Boca Raton, FL, 2008.
  * AINDONAL, John, BRAUN, John. Data anaysis and Graphics using R. Cambridge University Press, Cmabridge, 2nd edition, 2007.
  * Everitt, B. S., Hothorn, T. A Handbook of Statistical Analyses Using R, Second Edition (2 ed.) Chapman \& Hall. (2009)
  * Venables, W. N., & Ripley, B. D. Modern applied statistics with S. Birkhäuser. 2002.
  * Sarkar, D. Lattice: Multivariate Data Visualization with R (1 ed.) Springer. 2008.
  * Murrell, P. R Graphics (1 ed.) Chapman and {Hall/CRC}. 2005.
  * CRAWLEY, Michael J. Statistics: an introduction using R. Wiley, 2005.

==== Materiais do curso ====

  * Diretório com todos os {{http://www.leg.ufpr.br/~walmes/cursoR/unochapeco/|arquivos do Curso}};

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==== Links úteis ====

  * {{http://cran.r-project.org/|CRAN}}, o site do R: {{http://cran.r-project.org/bin/windows/base/|download}}, {{http://cran.r-project.org/manuals.html|manuais do R}} e {{http://cran.r-project.org/other-docs.html|tutoriais em geral}};
  * Página de {{http://www.rstudio.org/download/desktop|download do RStudio}}, a interface mais amigável do R;
  * Material do Curso do Professor {{http://www.leg.ufpr.br/doku.php/sofware:material-r|Paulo Justiniano Ribeiro Júnior}} (UFPR);
  * Material do Cursos do Professor {{http://www.dex.ufla.br/~danielff/index.htm|Daniel Furtado Ferreira}} (UFLA);
  * Dicas curtas sobre R, as {{http://www.leg.ufpr.br/doku.php/ridiculas|Rídiculas do LEG}};
  * Página de descrição da {{http://www.leg.ufpr.br/doku.php/software:rbr|[R-br]}}, a lista Brasileira oficial de usuários do R;
  * Arquivo de mensagens da [R-br] hospedada pelo {{http://r-br.2285057.n4.nabble.com/|Nabble}};
  * Página de R por {{http://zoonek2.free.fr/UNIX/48_R/all.html|Vincent Zoonekynd}} (muuuita coisa!);
  * Página de tutoriais em R para estatística, {{http://www.r-tutor.com/|R tutorial}};
  * {{http://www.r-bloggers.com/|R-bloggers}}, o blog dos blogs de R;
  * {{http://r-project.markmail.org/search/?q=|MarkMail}}, maior gerenciador de listas de discussão sobre R;
  * {{http://www.statmethods.net/index.html|Quick-R}}, blog de como fazer coisas com o R;
  * {{http://www.ats.ucla.edu/stat/|UCLA}} e {{http://www.ats.ucla.edu/stat/dae/|tutoriais}} sobre análise de dados com o R;
  * {{http://animation.yihui.name/|Aniwiki}}, animações didáticas com o R;
  * {{http://vgoulet.act.ulaval.ca/en/emacs/|Emacs}} para Windows;
  * {{http://rtricks.wordpress.com/|R-tricks}}, dicas e malandragens com o R;
  * {{http://egret.psychol.cam.ac.uk/statistics/R/graphs1.html|Gráficos básicos}} com o R;
  * {{http://sites.google.com/site/marcosfs2006/material_r|Materiais}} em português sobre R;
  * {{http://addictedtor.free.fr/graphiques/|R gallery}}, a galeria de gráficos requintados do R;
  * Página {{http://rwiki.sciviews.org/doku.php|WIKI}} do R;
  * {{http://www2.ekol.slu.se/wiki/index.php/Learn_R|Learn R}} da página do Departamento de Ecologia da Wright State University.
  * O básico de {{http://liutaiomottola.com/myth/expdesig.html|delineamento}} experimental;
  * {{http://www.r-tutor.com/|R-tutor}}, tutoriais sobre R;
  * {{http://cran.r-project.org/doc/contrib/Vikneswaran-ED_companion.pdf|Compendio}} R de delineamento experimental;
  * {{http://www.utdallas.edu/~herve/R_comp4Abdi_ExperimentalDesign.pdf|Compendio}} R para análise de delineamento experimental em psicologia;
  * Manual R de {{http://www.biostat.uni-hannover.de/fileadmin/institut/pdf/RMANUAL_ENGLISH.PDF|biometria}}, por Katharina Hoff;
  * Material do {{http://cran.r-project.org/doc/contrib/Faraway-PRA.pdf|John Faraway}}, Anova e regressão com o R;
  * Tutorial do {{http://www.rensenieuwenhuis.nl/documents/Applied%20R.pdf|Rense Nieuwenhuis}}, R aplicado para o cientista social quantitativo;
  * Manual R que acompanha o livro Categorical Data Analysis, por {{https://home.comcast.net/~lthompson221/Splusdiscrete2.pdf|Laura Thompson}}.
  * Página do Professor {{https://sites.google.com/site/ericbferreira/unifal/downloads-1|Eric Batista Ferreira}} desenvolvedor do pacote não oficial **ExpDes**;
  * Apostila de Estatística Experimental da Pesquisadora {{http://www.cnpab.embrapa.br/publicacoes/download/doc163.pdf|Janaína Ribeiro Costa}} (Embrapa);
  * Cartilha de referência do R por {{http://cran.r-project.org/doc/contrib/Short-refcard.pdf|Tom Short}}, traz um resumo das funções mais usadas;
  * Lista das abreviações dos pacotes e funções do R por {{http://jeromyanglim.blogspot.com/2010/05/abbreviations-of-r-commands-explained.html|Jeromy Anglim}};
  * Página da disciplina de {{http://www.leg.ufpr.br/ce223|Estatística Computacional}} que ensina o R como aplicativo estatístico e ferramenta computacional. Os scripts usados em aula estão disponíveis e são arquivos reproduzíveis.

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==== Referências bibliográficas ====
<bibtex>

@TechReport{ribeiro_jr-leg,
	url = {http://www.leg.ufpr.br/~paulojus/embrapa/Rembrapa/Rembrapa.pdf},
	year = {2009},
	author = {Paulo Justiniano {Ribeiro Júnior}},
	title = {Introdução ao Ambiente Estatístico R}
}

@TechReport{faraway-cran,
	url = {http://cran.r-project.org/doc/contrib/Faraway-PRA.pdf},
	year = {2002},
	author = {Julian J. Faraway},
	title = {Practical Regression and Anova using {R}}
}

@book{faraway_linear_2005,
        title = {Linear models with R},
        url = {http://www.leg.ufpr.br/~walmes/docs/Linear%20Models%20with%20R.pdf},
	isbn = {9781584884255},
	publisher = {Chapman \& Hall/{CRC}},
	author = {Julian James Faraway},
	year = {2005},
	pages = {244}
}

@book{venables_modern_2002,
	title = {Modern applied statistics with S},
        url = {http://www.leg.ufpr.br/~walmes/docs/Modern%20Applied%20Statistical%20Methods%20with%20S%20plus.pdf},
	isbn = {9780387954578},
	publisher = {Birkhäuser},
	author = {William N. Venables and Brian D. Ripley},
	year = {2002},
	pages = {518}
}


@book{everitt_handbook_2009,
	edition = {2},
	title = {A Handbook of Statistical Analyses Using R, Second Edition},
        %url = {http://www.maths.bath.ac.uk/~jjf23/ELM/},
        url = {http://www.leg.ufpr.br/~walmes/docs/A%20handbook%20of%20statistical%20analyses%20using%20R.pdf},
	isbn = {1420079336},
	publisher = {Chapman \& Hall},
	author = {Brian S. Everitt and Torsten Hothorn},
	month = jul,
	year = {2009}
}

@book{dalgaard_introductory_2008,
	edition = {2nd},
	title = {Introductory Statistics with R},
        url = {http://www.leg.ufpr.br/~walmes/docs/Introductory%20Statistics%20with%20R.pdf},
	isbn = {0387790535},
	publisher = {Springer},
	author = {Peter Dalgaard},
	month = aug,
	year = {2008}
}

@book{dobson_introduction_2008,
	edition = {3},
	title = {An Introduction to Generalized Linear Models, Third Edition},
        url = {http://www.leg.ufpr.br/~walmes/docs/An%20introduction%20to%20generalized%20linear%20models.pdf},
	isbn = {1584889500},
	publisher = {Chapman and {Hall/CRC}},
	author = {Annette J. Dobson and Adrian Barnett},
	month = may,
	year = {2008}
}

@book{ritz_nonlinear_2008,
	edition = {1},
	title = {Nonlinear Regression with R},
        url = {http://www.leg.ufpr.br/~walmes/docs/Nonlinear%20Regression%20with%20R.pdf},
	isbn = {0387096159},
	publisher = {Springer},
	author = {Christian Ritz and Jens Carl Streibig},
	month = nov,
	year = {2008}
}

@book{sarkar_lattice:_2008,
	edition = {1},
	title = {Lattice: Multivariate Data Visualization with R},
        url = {http://www.leg.ufpr.br/~walmes/docs/Lattice%20Multivariate%20Data%20Visualization%20with%20R.pdf},
	isbn = {0387759689},
	shorttitle = {Lattice},
	publisher = {Springer},
	author = {Deepayan Sarkar},
	month = mar,
	year = {2008}
}

@book{murrell_r_2005,
	edition = {1},
	title = {R Graphics},
        url = {http://www.leg.ufpr.br/~walmes/docs/R%20Graphics.pdf},
	isbn = {{158488486X}},
	publisher = {Chapman and {Hall/CRC}},
	author = {Paul Murrell},
	month = jul,
	year = {2005}
}

@book{maindonald_data_2010,
	edition = {3},
	title = {Data Analysis and Graphics Using R: An Example-Based Approach},
	isbn = {0521762936},
        url = {http://www.leg.ufpr.br/~walmes/docs/Data%20Analysis%20and%20Graphics%20Using%20R%203rd.pdf},
	shorttitle = {Data Analysis and Graphics Using R},
	publisher = {Cambridge University Press},
	author = {John Maindonald and W. John Braun},
	month = jun,
	year = {2010}
}

@book{pinheiro_mixed-effects_2009,
	edition = {1st ed. 2000. 2nd printing},
	title = {Mixed-Effects Models in S and {S-PLUS}},
        url = {http://www.leg.ufpr.br/~walmes/docs/Mixed%20Effects%20Models%20in%20S%20and%20S-Plus.pdf},
	isbn = {1441903178},
	publisher = {Springer},
	author = {Jos\'{e} Pinheiro and Douglas Bates},
	month = apr,
	year = {2009}
}

@book{cox_theory_2000,
	edition = {1},
	title = {The Theory of the Design of Experiments},
        url = {http://www.leg.ufpr.br/~walmes/docs/The%20theory%20of%20the%20design%20of%20experiments.pdf},
	isbn = {{158488195X}},
	publisher = {Chapman and {Hall/CRC}},
	author = {{D.R.} Cox and Nancy Reid},
	month = jun,
	year = {2000}
}

@TechReport{beasley:04,
	url = {http://www.leg.ufpr.br/~walmes/docs/Beasley-BioestatisticaUsandoR.pdf},
	year = {2004},
	author = {Colin Robert Beasley},
	title = {Bioestatística usando o R - apostila de exemplos para o biólogo}
}

@TechReport{correa-gonzales:2002,
	url = {http://www.leg.ufpr.br/~walmes/docs/Gr%c3%a1ficos%20Estat%c3%adsticos%20no%20R.pdf},
	year = {2002},
	author = {Juan Carlos Correa and Nelfi González},
	title = {Gráficos Estadísticos con R}
}

@TechReport{maia-etal:05,
	url = {http://www.leg.ufpr.br/~walmes/docs/Software%20Livre%20R%20-%20aplica%c3%a7%c3%a3o%20estat%c3%adstica%20(vi%c3%a7osa).pdf},
	year = {2005},
	author = {Emanuel Fernando Maia de Souza and Luiz Alexandre Peternelli and Márcio Pupin de Mello},
	title = {Software Livre R: aplicação estatística}
}

@TechReport{monteiro:06,
	url = {http://www.leg.ufpr.br/~walmes/docs/biometria.pdf},
	year = {2006},
	author = {Leandro R Monteiro},
	title = {Introdução à biometria usando o R}
}


</bibtex>

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==== Pacotes necessários a serem instalados ====

<code R>
# instala os pacotes oficiais usados durante curso via web
install.packages(c('agricolae', 'aod', 'car', 'contrast', 'ellipse', 'fBasics',
                   'fmsb', 'gmodels', 'gplots', 'HH', 'lattice', 'latticeExtra',
                   'lme4', 'multcomp', 'nls2', 'nlstools', 'plotrix', 'plyr',
                   'reshape', 'ScottKnott', 'doBy', 'nlrwr', 'memisc', 'bbmle',
                   'rootSolve', 'gdata', 'psych', 'Hmisc', 'ExpDes'), dep=TRUE, repos='http://cran-r.c3sl.ufpr.br/')
</code>

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