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dicas:lcpad [2009/04/17 17:20]
paulojus
dicas:lcpad [2015/06/09 18:46]
paulojus
Linha 31: Linha 31:
   * usar a servidora ''​lcpad.ufpr.br''​ para sessões interativas e/ou ''​jobs''​ rápidos   * usar a servidora ''​lcpad.ufpr.br''​ para sessões interativas e/ou ''​jobs''​ rápidos
   * usar as demais para ''​jobs''​ mais longos e/ou múltiplos ''​jobs''​   * usar as demais para ''​jobs''​ mais longos e/ou múltiplos ''​jobs''​
-  * Existem diversas máquinas adicionais (ver saida do comando ''​normas''​) tais como ''​a01-a10'',​ ''​h01-h04'',​ ''​o01-o03''​ (**dentre outras**). ​para acessar uma delas use o ''​rlogin''<​code>​ +  * Existem diversas máquinas adicionais (ver saida do comando ''​normas''​) tais como ''​a01-a10'',​ ''​h01-h04'',​ ''​o01-o03''​ (**dentre outras**). ​
-lcpad % rlogin a03 +
-a03 % +
-</​code>​+
   * para ver a lista de máquinas disponíveis digite em ''​lcpad'':<​code>​   * para ver a lista de máquinas disponíveis digite em ''​lcpad'':<​code>​
 lcpad % carga lcpad % carga
 +</​code>​
 +  * para acessar uma delas use o ''​rlogin''<​code>​
 +lcpad % rlogin bl03
 +bl03 %
 </​code>​ </​code>​
  
Linha 44: Linha 45:
 Existem duas versões do programa ''​R''​ disponíveis no LCPAD Existem duas versões do programa ''​R''​ disponíveis no LCPAD
   - Uma versão disponível para acesso **apenas na servidora ''​lcpad.ufpr.br''​** que pode ser usada inclusive interativamente e graficamente. Para iniciar esta versão do R em modo interativo digite:<​code>​   - Uma versão disponível para acesso **apenas na servidora ''​lcpad.ufpr.br''​** que pode ser usada inclusive interativamente e graficamente. Para iniciar esta versão do R em modo interativo digite:<​code>​
-% R </​code>​ +/​home/​users/​est/​paulojus/​R/​bin/​R </​code>​ 
-e para modo BATCH o comando usual e acompanha o andamento do //job// com:<​code>​+Voce pode (deve) crirar um //​alias// ​para o comando acima no sistema<​code>​ 
 +% alias R='/​home/​users/​est/​paulojus/​R/​bin/​R'​ 
 +</​code>​ 
 +Para modo BATCH o comando usual e acompanha o andamento do //job// com:<​code>​
 % R CMD BATCH seu_programa.R & % R CMD BATCH seu_programa.R &
 % tail -f seu_programa.Rout % tail -f seu_programa.Rout
 </​code> ​ </​code> ​
   - Nas demais máquinas do LCPAD não é possivel utilizar o R gráfico e foi compilada uma versão sem suporte gráfico do ''​R''​ que chamamos de ''​Rnox''​. Par usar esta versão voce deve primeiro criar um //alias// nos seu arquivo ''​.bashrc''​ e/ou ''​.zshrc''​ (se voce copiou estes arquivos da conta de PJ isto não é necessário pois o //alias// já está nos arquivos copiados): <​code>​   - Nas demais máquinas do LCPAD não é possivel utilizar o R gráfico e foi compilada uma versão sem suporte gráfico do ''​R''​ que chamamos de ''​Rnox''​. Par usar esta versão voce deve primeiro criar um //alias// nos seu arquivo ''​.bashrc''​ e/ou ''​.zshrc''​ (se voce copiou estes arquivos da conta de PJ isto não é necessário pois o //alias// já está nos arquivos copiados): <​code>​
-alias Rnox="​nice -n 19 /​home/​users/​est/​paulojus/​R/​bin/​R" ​+alias Rnox="​nice -n 19 /​home/​users/​est/​paulojus/​Rnox/​bin/​R" ​
 source .bashrc source .bashrc
 source .zshrc source .zshrc
Linha 78: Linha 82:
  
 No caso do ''​Rnox''​ esta última solução pode ser //​automatizada//​ mudando o seu //​alias// ​ em ''​.zshrc''​ para:<​code>​ No caso do ''​Rnox''​ esta última solução pode ser //​automatizada//​ mudando o seu //​alias// ​ em ''​.zshrc''​ para:<​code>​
-alias Rnox="​nice -n 19 nohup /​home/​users/​est/​paulojus/​R/​bin/​R" ​+alias Rnox="​nice -n 19 nohup /​home/​users/​est/​paulojus/​Rnox/​bin/​R" ​
 source .zshrc source .zshrc
 </​code>​ </​code>​

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