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dicas:ccad [2010/07/22 19:16]
paulojus
dicas:ccad [2011/10/07 11:32] (atual)
paulojus
Linha 20: Linha 20:
   * O usuário cadastrado receberá email com login e senha de acesso.   * O usuário cadastrado receberá email com login e senha de acesso.
   * o acesso deve ser feito sempre à servidora ''​ccad.ufpr.br'' ​   * o acesso deve ser feito sempre à servidora ''​ccad.ufpr.br'' ​
-  * a partir desta servidora é possível acessar as demais máquinas do LCPAD via o comando ''​rlogin''​ (mais detalhes abaixo) 
   * O acesso à servidora ​ ''​ccad.ufpr.br''​ pode ser feito por ''​ssh''​ (inclusive gráfico com ''​ssh -X''​) via programa gráfico de ssh (putty, etc) ou linha de comando com:<​code>​   * O acesso à servidora ​ ''​ccad.ufpr.br''​ pode ser feito por ''​ssh''​ (inclusive gráfico com ''​ssh -X''​) via programa gráfico de ssh (putty, etc) ou linha de comando com:<​code>​
 $ ssh LOGIN@ccad.ufpr.br</​code>​ $ ssh LOGIN@ccad.ufpr.br</​code>​
Linha 79: Linha 78:
 #PBS -m ae                    ​ #PBS -m ae                    ​
 #PBS -M paulojus@leg.ufpr.br ​     #PBS -M paulojus@leg.ufpr.br ​    
 +#PBS -l walltime=6:​00:​00
 cd $PBS_O_WORKDIR cd $PBS_O_WORKDIR
  
Linha 85: Linha 85:
 ccad:~> qsub run.sh </​code>​ ccad:~> qsub run.sh </​code>​
   - Monitorar o progresso com<​code>​   - Monitorar o progresso com<​code>​
-ccad:~> qstat run.sh</​code>​+ccad:~> qstat </​code>​
   - E também monitorar da forma usual o arquivo de saída do R<​code>​   - E também monitorar da forma usual o arquivo de saída do R<​code>​
 ccad:~> tail -f seu_programa.Rout ccad:~> tail -f seu_programa.Rout
Linha 95: Linha 95:
 O CCAD disponibiliza informações adicionais sobre [[http://​www.ccad.ufpr.br/​wiki/​index.php/​Submiss%C3%A3o|submissão e controle de processos em sua página]].\\ O CCAD disponibiliza informações adicionais sobre [[http://​www.ccad.ufpr.br/​wiki/​index.php/​Submiss%C3%A3o|submissão e controle de processos em sua página]].\\
 Se tiverem dicas de uso para o R coloquem aqui!!! Se tiverem dicas de uso para o R coloquem aqui!!!
 +
 +=== Tempo de processamento ===
 +
 +Por //default// o CCAD interrompe os processos após uma (1) hora de processamento.
 +No exemplo de arquivo ''​run.sh''​ acima já modificamos
 +este tempo, para seis (6) horas, incluindo no seu arquivo:
 +   #PBS -l walltime=6:​00:​00
 +Ajuste este tempo de acordo com a sua necessidade.
  
 === Pacotes do R === === Pacotes do R ===
-Pacotes adicionais podem ser instlados ​em sua conta se desejado.+Pacotes adicionais podem ser instalados ​em sua conta se desejado.
 Entretanto para evitar replicação de instalações estamos centralizando a instalação de pacotes na conta de PJ. Entretanto para evitar replicação de instalações estamos centralizando a instalação de pacotes na conta de PJ.
 O módulo do R (''​mod_R''​) faz este direcionamento. ​ O módulo do R (''​mod_R''​) faz este direcionamento. ​

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